More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0855 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  100 
 
 
904 aa  1876    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  97.35 
 
 
904 aa  1838    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  46.88 
 
 
901 aa  780    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  97.68 
 
 
904 aa  1835    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  46.24 
 
 
897 aa  796    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  98.23 
 
 
904 aa  1849    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  36.44 
 
 
869 aa  536  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  35.95 
 
 
873 aa  498  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  35.73 
 
 
873 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  34.83 
 
 
907 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 
907 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  33.23 
 
 
953 aa  437  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  33.84 
 
 
981 aa  436  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  33.22 
 
 
843 aa  422  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  33.88 
 
 
853 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 
853 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  33.08 
 
 
842 aa  414  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 
853 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  33.84 
 
 
853 aa  415  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  33.93 
 
 
853 aa  412  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 
841 aa  405  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 
924 aa  401  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  33.03 
 
 
838 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 
935 aa  398  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 
855 aa  399  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 
855 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  32.58 
 
 
839 aa  399  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 
817 aa  396  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  32.05 
 
 
836 aa  391  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 
965 aa  382  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 
933 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 
935 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 
930 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 
935 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 
930 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 
937 aa  372  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 
935 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 
930 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 
912 aa  363  6e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 
966 aa  357  5e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  30.13 
 
 
966 aa  356  1e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  30.72 
 
 
936 aa  352  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  34.97 
 
 
709 aa  343  7e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 
952 aa  335  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 
1088 aa  335  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 
938 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 
981 aa  325  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 
987 aa  324  5e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 
975 aa  323  8e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 
976 aa  320  7e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 
985 aa  313  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 
944 aa  311  2e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 
946 aa  310  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  28.56 
 
 
974 aa  308  3e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 
957 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 
951 aa  302  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  27.8 
 
 
929 aa  300  6e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 
951 aa  298  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 
944 aa  295  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 
976 aa  293  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 
935 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 
947 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 
910 aa  277  7e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 
966 aa  277  8e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 
966 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 
940 aa  275  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  29.23 
 
 
961 aa  272  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 
861 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 
861 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 
861 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 
857 aa  265  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 
969 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 
852 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 
855 aa  263  8e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 
948 aa  262  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 
964 aa  262  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 
861 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 
849 aa  261  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 
861 aa  259  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 
861 aa  259  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 
847 aa  258  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 
914 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 
867 aa  255  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 
886 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 
867 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2508  TonB-dependent receptor, plug  26.4 
 
 
1015 aa  252  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.636231  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 
886 aa  252  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 
1020 aa  250  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 
867 aa  249  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 
1007 aa  248  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 
867 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 
1015 aa  247  8e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 
875 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 
871 aa  246  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  25.54 
 
 
914 aa  245  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 
882 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 
1040 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 
882 aa  244  7e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2379  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 
1034 aa  243  7.999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0591037  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  25.3 
 
 
1009 aa  243  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>