More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5429 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  46.33 
 
 		 953 aa  793    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1088 aa  2211    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  36.41 
 
 		 935 aa  543  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  35.74 
 
 		 981 aa  489  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  34.87 
 
 		 933 aa  484  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  34.96 
 
 		 935 aa  483  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  34.96 
 
 		 935 aa  483  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  34.96 
 
 		 935 aa  483  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 937 aa  477  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  34.1 
 
 		 936 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  34.24 
 
 		 930 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  34.34 
 
 		 930 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  34.24 
 
 		 930 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 		 987 aa  427  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  32.7 
 
 		 952 aa  409  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 981 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  31.38 
 
 		 985 aa  405  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  31.66 
 
 		 974 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 944 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 965 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 975 aa  365  3e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 869 aa  353  1e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 904 aa  342  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 907 aa  342  2.9999999999999998e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 873 aa  341  5e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 904 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 904 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 873 aa  338  5e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 966 aa  337  7.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 904 aa  336  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 897 aa  332  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  28.56 
 
 		 966 aa  327  5e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 924 aa  327  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 		 901 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 907 aa  319  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 855 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 838 aa  314  5.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 		 855 aa  313  9e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 843 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 947 aa  298  3e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 841 aa  297  6e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 853 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 853 aa  296  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 912 aa  296  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 853 aa  296  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  28 
 
 		 853 aa  293  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 853 aa  292  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 836 aa  290  8e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  28.44 
 
 		 914 aa  287  9e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 842 aa  285  4.0000000000000003e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 946 aa  278  3e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  26.52 
 
 		 839 aa  277  6e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  28.95 
 
 		 929 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 951 aa  265  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  29.58 
 
 		 709 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 944 aa  261  6e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 817 aa  259  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 957 aa  258  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 1015 aa  258  5e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 875 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  26.66 
 
 		 1007 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 966 aa  255  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 1007 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 1007 aa  254  7e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 935 aa  254  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 1007 aa  252  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.93 
 
 		 969 aa  249  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4293  TonB-dependent receptor plug  28.78 
 
 		 973 aa  249  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  0.297709 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 910 aa  248  6e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 964 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 982 aa  244  9e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 969 aa  243  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 891 aa  234  8.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 966 aa  233  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 938 aa  233  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 948 aa  232  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 967 aa  231  8e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 879 aa  229  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 869 aa  229  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 883 aa  228  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 871 aa  228  6e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 883 aa  228  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 883 aa  228  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 976 aa  228  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 1040 aa  228  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 1020 aa  226  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 951 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  26.07 
 
 		 961 aa  221  7e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 855 aa  219  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 861 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 861 aa  217  8e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 861 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 852 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  27.27 
 
 		 884 aa  215  4.9999999999999996e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 861 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 861 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 861 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 847 aa  213  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 857 aa  209  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 894 aa  209  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>