More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3144 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  42.52 
 
 		 966 aa  724    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1040 aa  2135    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  41.45 
 
 		 929 aa  706    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  37.1 
 
 		 948 aa  597  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1368  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 		 958 aa  514  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000266767  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1437  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 		 958 aa  513  1e-144  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.15469  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 1020 aa  421  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  31.2 
 
 		 961 aa  406  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.78 
 
 		 969 aa  395  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 976 aa  338  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 935 aa  334  5e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 907 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 976 aa  313  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 907 aa  311  5.9999999999999995e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 914 aa  302  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 922 aa  300  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 981 aa  298  4e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 957 aa  296  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 965 aa  295  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 939 aa  292  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 924 aa  287  7e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 869 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 951 aa  283  9e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 951 aa  283  9e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 901 aa  283  1e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 897 aa  283  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 944 aa  279  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 935 aa  276  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 998 aa  272  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  27.8 
 
 		 966 aa  269  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 966 aa  269  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 966 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 912 aa  263  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 838 aa  263  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 843 aa  262  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 853 aa  262  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 841 aa  262  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 873 aa  261  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 873 aa  259  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 853 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 853 aa  256  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 853 aa  256  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  26.75 
 
 		 839 aa  255  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 946 aa  254  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  27.13 
 
 		 853 aa  253  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 947 aa  253  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 937 aa  251  6e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 940 aa  250  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 1007 aa  249  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 855 aa  249  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 904 aa  248  6e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 836 aa  248  6e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  26.33 
 
 		 936 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  25.94 
 
 		 1007 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 1007 aa  243  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 1007 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 910 aa  241  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 933 aa  241  6.999999999999999e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 855 aa  239  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 842 aa  240  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 930 aa  237  7e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 930 aa  237  7e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 935 aa  235  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 935 aa  235  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 935 aa  235  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 930 aa  235  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2400  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 1004 aa  232  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 987 aa  230  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 944 aa  222  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 1015 aa  218  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 1088 aa  217  9e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 920 aa  217  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02110  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 824 aa  214  5.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806271  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 981 aa  214  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 1009 aa  209  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 967 aa  204  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  27.19 
 
 		 709 aa  204  9e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 817 aa  203  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 1000 aa  203  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 953 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 969 aa  196  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 901 aa  195  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 869 aa  188  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 938 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 875 aa  183  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  25.37 
 
 		 877 aa  179  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 904 aa  173  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 890 aa  171  9e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 890 aa  170  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1228  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 1057 aa  169  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0919786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 964 aa  164  9e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 879 aa  158  6e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 904 aa  157  9e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4293  TonB-dependent receptor plug  24.7 
 
 		 973 aa  153  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  0.297709 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 904 aa  153  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  22.22 
 
 		 896 aa  153  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 1028 aa  151  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 904 aa  151  8e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3922  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 948 aa  148  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.719329  normal  0.0833572 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 		 985 aa  147  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>