More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1970 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 976 aa  1983    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  41.17 
 
 		 976 aa  658    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  38.38 
 
 		 998 aa  631  1e-179  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 935 aa  399  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  29.93 
 
 		 961 aa  340  9.999999999999999e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 944 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 869 aa  326  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 901 aa  326  1e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 897 aa  323  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 904 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 904 aa  320  7e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 966 aa  320  9e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 957 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 922 aa  314  4.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 904 aa  312  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 1040 aa  311  4e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 904 aa  311  5e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 920 aa  310  9e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 1020 aa  307  6e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 951 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 966 aa  301  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 924 aa  300  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 969 aa  297  7e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  28.56 
 
 		 929 aa  296  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 947 aa  291  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 946 aa  289  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 939 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 873 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 907 aa  283  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 1028 aa  281  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.58 
 
 		 969 aa  281  5e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 873 aa  280  9e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 907 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 940 aa  278  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 914 aa  275  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 935 aa  274  5.000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 938 aa  274  6e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 951 aa  273  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 948 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 967 aa  271  5.9999999999999995e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 843 aa  265  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 1007 aa  263  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 841 aa  263  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 1007 aa  263  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 1000 aa  263  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 1007 aa  261  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 953 aa  259  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  28.07 
 
 		 1007 aa  258  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 1009 aa  251  6e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 836 aa  249  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 853 aa  247  8e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3783  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 		 987 aa  247  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0591  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 1032 aa  245  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.880997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 855 aa  241  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 987 aa  241  5e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 855 aa  240  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  26.4 
 
 		 853 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  26.4 
 
 		 853 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  26.77 
 
 		 853 aa  238  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  26.4 
 
 		 853 aa  238  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  26.14 
 
 		 839 aa  237  9e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2400  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 1004 aa  236  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2379  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 1034 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0591037  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 981 aa  235  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 944 aa  235  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  26.95 
 
 		 936 aa  228  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 838 aa  228  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 1015 aa  224  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  24.49 
 
 		 966 aa  224  8e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 981 aa  223  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 935 aa  221  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 935 aa  221  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 935 aa  221  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 937 aa  219  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 1088 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 817 aa  215  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 930 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 930 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 930 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 975 aa  214  4.9999999999999996e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 974 aa  214  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 933 aa  213  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 952 aa  213  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 982 aa  212  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 909 aa  208  5e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  25.73 
 
 		 884 aa  206  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 855 aa  206  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 883 aa  205  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 883 aa  205  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 847 aa  204  8e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 985 aa  204  9e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 883 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1677  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 1041 aa  201  5e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 852 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 871 aa  200  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  27.45 
 
 		 709 aa  197  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 872 aa  197  9e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 869 aa  197  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 869 aa  196  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 857 aa  195  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>