More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2379 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2379  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1034 aa  2081    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0591037  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 982 aa  436  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2508  TonB-dependent receptor, plug  27.82 
 
 		 1015 aa  338  3.9999999999999995e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.636231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 901 aa  316  9.999999999999999e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 897 aa  294  7e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 981 aa  274  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2026  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 1068 aa  273  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00076043  normal  0.701552 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 904 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 904 aa  260  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 904 aa  260  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 904 aa  257  8e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 966 aa  251  7e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 946 aa  246  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 869 aa  241  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 976 aa  241  5e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 951 aa  235  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 935 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 976 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 907 aa  228  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 998 aa  228  6e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 966 aa  224  6e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 952 aa  224  8e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 922 aa  223  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  27.31 
 
 		 966 aa  218  5.9999999999999996e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 947 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 948 aa  214  7.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 873 aa  213  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 944 aa  212  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 924 aa  212  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 933 aa  209  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  24.98 
 
 		 930 aa  207  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 930 aa  206  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 930 aa  206  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 935 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 935 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 935 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 966 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 907 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  24.48 
 
 		 936 aa  199  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 1088 aa  198  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 1020 aa  198  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 957 aa  194  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.01 
 
 		 969 aa  193  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 1015 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 981 aa  192  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 1028 aa  191  7e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1677  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 1041 aa  188  4e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  26.18 
 
 		 961 aa  187  6e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 987 aa  187  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1752  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 1041 aa  186  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0957088  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 939 aa  185  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 1009 aa  184  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 875 aa  183  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 912 aa  179  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 869 aa  179  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 1000 aa  173  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 956 aa  170  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 910 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 944 aa  162  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0591  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 1032 aa  161  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.880997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2548  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 1001 aa  160  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  26.27 
 
 		 880 aa  160  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2400  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 1004 aa  155  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  25.02 
 
 		 928 aa  154  8e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1368  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 958 aa  154  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000266767  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  38.33 
 
 		 873 aa  150  8e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1437  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 958 aa  150  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.15469  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 920 aa  150  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5189  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 981 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1120  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 942 aa  149  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264761 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  23.21 
 
 		 922 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 914 aa  142  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 883 aa  141  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0703  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 954 aa  140  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917927 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 925 aa  140  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2243  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 1000 aa  139  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 951 aa  136  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 965 aa  135  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 		 836 aa  135  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  38.31 
 
 		 817 aa  133  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  36.29 
 
 		 964 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4293  TonB-dependent receptor plug  26.31 
 
 		 973 aa  132  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  0.297709 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  37.39 
 
 		 937 aa  132  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  34.89 
 
 		 841 aa  132  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  37.39 
 
 		 839 aa  132  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  33.05 
 
 		 891 aa  131  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 874 aa  131  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  34.52 
 
 		 838 aa  131  8.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  36.12 
 
 		 842 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 935 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  36.77 
 
 		 853 aa  128  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  36.77 
 
 		 853 aa  128  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  36.77 
 
 		 853 aa  128  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 843 aa  127  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  35.44 
 
 		 853 aa  127  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  37.79 
 
 		 855 aa  127  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 935 aa  127  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 967 aa  126  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  37.88 
 
 		 853 aa  126  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  35.32 
 
 		 1040 aa  127  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>