More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2026 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2026  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1068 aa  2180    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00076043  normal  0.701552 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2508  TonB-dependent receptor, plug  33.53 
 
 		 1015 aa  479  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.636231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 982 aa  333  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2379  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 1034 aa  270  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0591037  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 969 aa  252  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 1015 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 951 aa  226  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 1009 aa  226  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 946 aa  221  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 981 aa  211  7e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 1007 aa  209  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 1007 aa  207  8e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  24.84 
 
 		 1007 aa  207  8e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 947 aa  207  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 1007 aa  204  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 904 aa  201  6e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 1028 aa  186  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0591  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 1032 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.880997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.75 
 
 		 969 aa  177  7e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 1088 aa  176  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  25.41 
 
 		 961 aa  164  6e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 953 aa  162  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 981 aa  162  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 909 aa  160  8e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1677  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1041 aa  159  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02110  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 824 aa  158  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806271  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  42.26 
 
 		 842 aa  157  9e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  37.89 
 
 		 839 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1752  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 1041 aa  155  4e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0957088  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 1020 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  42.02 
 
 		 966 aa  154  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  37.85 
 
 		 836 aa  153  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 909 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  34.97 
 
 		 841 aa  147  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  34.95 
 
 		 843 aa  147  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  41.06 
 
 		 873 aa  146  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  39.2 
 
 		 869 aa  145  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5189  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 981 aa  144  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  37.21 
 
 		 709 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  39 
 
 		 855 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  36.96 
 
 		 907 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  38 
 
 		 853 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  38.52 
 
 		 873 aa  142  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  38.04 
 
 		 838 aa  142  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  41.87 
 
 		 853 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  39.66 
 
 		 853 aa  140  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 935 aa  140  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  39.66 
 
 		 853 aa  140  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  39.5 
 
 		 883 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  39.5 
 
 		 883 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  39.66 
 
 		 853 aa  140  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  26.11 
 
 		 966 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  39.09 
 
 		 897 aa  138  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  39 
 
 		 883 aa  137  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  41.67 
 
 		 817 aa  137  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  44.21 
 
 		 861 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  44.21 
 
 		 861 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  37.87 
 
 		 855 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  44.21 
 
 		 861 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 987 aa  136  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 950 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  42.49 
 
 		 852 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  37.39 
 
 		 884 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  38.87 
 
 		 907 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  42.55 
 
 		 855 aa  135  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 957 aa  135  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  34.09 
 
 		 925 aa  135  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  37.61 
 
 		 872 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  40.09 
 
 		 861 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  35.37 
 
 		 914 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  42.19 
 
 		 861 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  36.08 
 
 		 869 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  42.11 
 
 		 861 aa  132  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  34.91 
 
 		 904 aa  131  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  40.2 
 
 		 849 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  40.62 
 
 		 847 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 904 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 904 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 901 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  40.72 
 
 		 857 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  35.89 
 
 		 937 aa  129  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  39.22 
 
 		 871 aa  128  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  34.51 
 
 		 876 aa  128  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  34.69 
 
 		 944 aa  128  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 935 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 935 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 935 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 930 aa  127  9e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 944 aa  127  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  38.5 
 
 		 922 aa  127  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  33.82 
 
 		 886 aa  127  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4293  TonB-dependent receptor plug  25.15 
 
 		 973 aa  127  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  0.297709 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 882 aa  127  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  33.82 
 
 		 886 aa  127  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  36.07 
 
 		 951 aa  127  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 930 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 930 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 882 aa  126  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 967 aa  123  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  38.31 
 
 		 896 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>