More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2427 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 966 aa  1980    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  48.23 
 
 		 966 aa  880    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  35.11 
 
 		 936 aa  496  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  35.1 
 
 		 981 aa  494  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  33.99 
 
 		 935 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  34.63 
 
 		 930 aa  492  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  34.43 
 
 		 930 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  33.99 
 
 		 935 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  33.99 
 
 		 935 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  34.43 
 
 		 930 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  35.75 
 
 		 965 aa  488  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  33.95 
 
 		 937 aa  483  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  34.06 
 
 		 933 aa  478  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  34.42 
 
 		 935 aa  443  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  33.17 
 
 		 907 aa  431  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 907 aa  428  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 843 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 912 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 897 aa  402  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 841 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 924 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 869 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 855 aa  396  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 953 aa  395  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  31.9 
 
 		 952 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 873 aa  385  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 873 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 966 aa  385  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 836 aa  382  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 855 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 957 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 981 aa  371  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 		 944 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  32.09 
 
 		 938 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 853 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  30.58 
 
 		 853 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  30.21 
 
 		 839 aa  365  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 904 aa  364  4e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 904 aa  364  4e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 853 aa  364  4e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 		 853 aa  362  3e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 		 853 aa  362  3e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 951 aa  355  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 904 aa  355  2e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 904 aa  352  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 987 aa  351  3e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 944 aa  346  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 974 aa  342  1e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 946 aa  343  1e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  28.95 
 
 		 961 aa  342  2e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 985 aa  336  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 951 aa  336  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 1088 aa  334  6e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 948 aa  334  6e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 975 aa  333  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 901 aa  332  2e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 817 aa  331  3e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  29.56 
 
 		 929 aa  330  7e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  28.57 
 
 		 914 aa  328  3e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 947 aa  327  5e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4293  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 973 aa  324  4e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  0.297709 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 910 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.83 
 
 		 969 aa  316  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 966 aa  303  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 1015 aa  301  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 967 aa  301  5e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  30.55 
 
 		 899 aa  298  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 868 aa  297  8e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 876 aa  293  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 896 aa  293  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 869 aa  293  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 842 aa  293  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 935 aa  290  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 872 aa  280  8e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  28.37 
 
 		 895 aa  279  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 1040 aa  278  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 1007 aa  278  5e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 1009 aa  278  5e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 1007 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  28.28 
 
 		 896 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 852 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 909 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 1007 aa  272  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 969 aa  272  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  26.27 
 
 		 1007 aa  272  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 855 aa  270  8e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 869 aa  269  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 909 aa  268  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 849 aa  268  5e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 1020 aa  266  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 890 aa  265  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 861 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 890 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 861 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 891 aa  264  6e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 1028 aa  264  6e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 861 aa  264  6e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 861 aa  264  6e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 882 aa  264  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 861 aa  263  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>