More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0991 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  82.43 
 
 		 922 aa  1553    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 925 aa  1903    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 890 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 890 aa  392  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 890 aa  385  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  31.61 
 
 		 866 aa  364  5.0000000000000005e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  29.21 
 
 		 899 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  30.24 
 
 		 895 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  29.86 
 
 		 893 aa  332  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 896 aa  327  7e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 912 aa  327  9e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 872 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1120  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 942 aa  304  6.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 875 aa  292  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 896 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 800 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37900  putative TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 846 aa  283  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00691809  normal  0.333573 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 908 aa  283  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 909 aa  280  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  27.81 
 
 		 827 aa  279  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 909 aa  279  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 867 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 869 aa  274  6e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 867 aa  274  6e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 866 aa  273  7e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 867 aa  270  8e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 924 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 924 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 924 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 867 aa  268  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1769  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 985 aa  267  7e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 951 aa  265  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 944 aa  258  5e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 852 aa  257  6e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 950 aa  257  8e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 861 aa  255  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 869 aa  253  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 861 aa  251  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 861 aa  250  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 849 aa  249  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 871 aa  248  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 861 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 861 aa  248  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 861 aa  248  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 855 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 857 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 937 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 935 aa  244  7e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 935 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  26.14 
 
 		 966 aa  243  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 910 aa  243  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 935 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 935 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 847 aa  242  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 873 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 930 aa  241  5e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 930 aa  241  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 873 aa  241  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 930 aa  241  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 879 aa  239  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 966 aa  239  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  27.01 
 
 		 936 aa  237  6e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 843 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 981 aa  234  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 855 aa  234  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2871  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 935 aa  233  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 841 aa  233  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  27.21 
 
 		 853 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  27.21 
 
 		 853 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  27.11 
 
 		 853 aa  231  6e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 842 aa  229  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 987 aa  228  5.0000000000000005e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 944 aa  227  9e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 855 aa  225  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 933 aa  226  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  25.87 
 
 		 834 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 836 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 952 aa  223  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 876 aa  220  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 904 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 941 aa  218  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 897 aa  218  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 941 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03827  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 892 aa  218  5.9999999999999996e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 941 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 953 aa  217  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 904 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 904 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 904 aa  212  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2693  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 1006 aa  211  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 924 aa  208  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 951 aa  207  6e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 946 aa  207  8e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 874 aa  206  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 975 aa  206  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 944 aa  203  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 927 aa  201  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 938 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 947 aa  196  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 1015 aa  196  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>