More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03827 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03827  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 892 aa  1833    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  36.3 
 
 		 908 aa  586  1e-166  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2871  TonB-dependent receptor  38.65 
 
 		 935 aa  579  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  37.53 
 
 		 912 aa  578  1.0000000000000001e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1120  TonB-dependent receptor  37.16 
 
 		 942 aa  571  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264761 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37900  putative TonB-dependent receptor  36.63 
 
 		 846 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00691809  normal  0.333573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3124  TonB-dependent receptor  36.13 
 
 		 973 aa  511  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1769  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 		 985 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 896 aa  257  8e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 890 aa  256  9e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 890 aa  253  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  26.33 
 
 		 899 aa  249  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  26.1 
 
 		 895 aa  244  7.999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 879 aa  206  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 925 aa  204  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  24.1 
 
 		 884 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 869 aa  195  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 874 aa  194  8e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 883 aa  193  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 883 aa  193  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 883 aa  191  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 956 aa  191  5.999999999999999e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 852 aa  190  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3922  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 948 aa  188  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.719329  normal  0.0833572 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 867 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 867 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 875 aa  178  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03700  TonB-dependent outer membrane receptor  28.46 
 
 		 532 aa  178  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 909 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 927 aa  171  7e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 847 aa  170  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 861 aa  170  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 857 aa  169  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 861 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 981 aa  169  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 928 aa  164  7e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 893 aa  163  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2548  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 1001 aa  161  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 953 aa  160  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 952 aa  158  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 944 aa  157  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 853 aa  157  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 907 aa  156  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 907 aa  153  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 903 aa  149  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 890 aa  148  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 914 aa  145  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  24.68 
 
 		 834 aa  145  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 946 aa  145  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 935 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 		 969 aa  142  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03701  TonB-dependent outer membrane receptor  34.8 
 
 		 311 aa  141  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  27.39 
 
 		 893 aa  141  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  41.21 
 
 		 866 aa  137  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 897 aa  132  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 876 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  36.32 
 
 		 922 aa  126  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 950 aa  122  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 901 aa  121  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 924 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 924 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 924 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 867 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 800 aa  118  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 867 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 935 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  40.59 
 
 		 944 aa  115  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  31.72 
 
 		 827 aa  115  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  38.37 
 
 		 906 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  38.37 
 
 		 906 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1705  TonB-dependent receptor  38.37 
 
 		 906 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278713  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 		 896 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 891 aa  114  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  37.37 
 
 		 861 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  37.37 
 
 		 861 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  37.37 
 
 		 861 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 981 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  36.26 
 
 		 869 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1447  TonB-dependent receptor  38.37 
 
 		 914 aa  111  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  36.61 
 
 		 873 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1132  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 930 aa  110  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.746055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 982 aa  110  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  36.32 
 
 		 861 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  36.61 
 
 		 873 aa  110  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  37.79 
 
 		 913 aa  110  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  36.78 
 
 		 941 aa  110  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  36.78 
 
 		 941 aa  110  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  36.13 
 
 		 855 aa  108  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 817 aa  108  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 836 aa  107  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 		 939 aa  107  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  33.84 
 
 		 987 aa  107  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 1055 aa  107  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  36.22 
 
 		 849 aa  106  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 872 aa  105  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0703  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 954 aa  105  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917927 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  34.54 
 
 		 914 aa  105  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.59 
 
 		 969 aa  104  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  38.64 
 
 		 855 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  35.63 
 
 		 974 aa  103  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>