More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03701 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03701  TonB-dependent outer membrane receptor  100 
 
 		 311 aa  640    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1769  TonB-dependent receptor  60.07 
 
 		 985 aa  375  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  48.04 
 
 		 912 aa  179  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  45.07 
 
 		 908 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37900  putative TonB-dependent receptor  40.98 
 
 		 846 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00691809  normal  0.333573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3124  TonB-dependent receptor  44.16 
 
 		 973 aa  162  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  41.71 
 
 		 866 aa  152  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  45.45 
 
 		 922 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  38.59 
 
 		 890 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  38.59 
 
 		 890 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  42.35 
 
 		 890 aa  149  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  41.23 
 
 		 925 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  38.83 
 
 		 895 aa  142  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  38.42 
 
 		 899 aa  142  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03827  TonB-dependent receptor  34.8 
 
 		 892 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  38.34 
 
 		 896 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  39.47 
 
 		 893 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  40.1 
 
 		 874 aa  139  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1120  TonB-dependent receptor  37.08 
 
 		 942 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264761 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  38.57 
 
 		 827 aa  136  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  34.63 
 
 		 861 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  35.8 
 
 		 861 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  34.63 
 
 		 861 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  35.36 
 
 		 991 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  37.62 
 
 		 896 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  35.95 
 
 		 861 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  35.95 
 
 		 861 aa  130  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  34.78 
 
 		 909 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  35.54 
 
 		 861 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  38.68 
 
 		 872 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  34.41 
 
 		 884 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  37.84 
 
 		 883 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  37.84 
 
 		 883 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  38.68 
 
 		 883 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  37.32 
 
 		 985 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  36.27 
 
 		 909 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  33.99 
 
 		 855 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2871  TonB-dependent receptor  42.77 
 
 		 935 aa  125  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  38.73 
 
 		 852 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  34.94 
 
 		 879 aa  123  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  34.73 
 
 		 875 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 		 857 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  38.16 
 
 		 944 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  36.62 
 
 		 849 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  36.24 
 
 		 847 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  32.99 
 
 		 956 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  33.08 
 
 		 871 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  36.97 
 
 		 975 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2243  TonB-dependent receptor  38.52 
 
 		 1000 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  35.86 
 
 		 944 aa  119  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  35.56 
 
 		 866 aa  117  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  35.68 
 
 		 869 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  37.88 
 
 		 867 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  35.78 
 
 		 869 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 952 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  37.16 
 
 		 886 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  37.16 
 
 		 886 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  35.21 
 
 		 953 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  35.41 
 
 		 981 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  39 
 
 		 868 aa  113  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  35.64 
 
 		 974 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  36 
 
 		 892 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  36.87 
 
 		 897 aa  112  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  36.87 
 
 		 867 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  34.91 
 
 		 869 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  37.56 
 
 		 876 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  36.87 
 
 		 867 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  36.76 
 
 		 938 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  36.87 
 
 		 867 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  36.06 
 
 		 928 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  41.67 
 
 		 927 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  32.51 
 
 		 842 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  40.66 
 
 		 967 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  33.63 
 
 		 891 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 843 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  37.17 
 
 		 882 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  36.99 
 
 		 882 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  34.5 
 
 		 924 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  34.5 
 
 		 924 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  34.5 
 
 		 924 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 1009 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  34.74 
 
 		 914 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 982 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  46.9 
 
 		 966 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 987 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 836 aa  106  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 873 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2508  TonB-dependent receptor, plug  33.98 
 
 		 1015 aa  104  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.636231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 981 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  42.94 
 
 		 929 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 841 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  34.67 
 
 		 894 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  32.93 
 
 		 839 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  34.31 
 
 		 907 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  35.12 
 
 		 853 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  35.12 
 
 		 853 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  35.38 
 
 		 853 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 933 aa  103  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2531  TonB-dependent receptor  40.49 
 
 		 843 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 853 aa  103  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>