More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1883 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  57.64 
 
 		 944 aa  1032    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  96.44 
 
 		 927 aa  1826    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 928 aa  1894    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3922  TonB-dependent receptor  33.23 
 
 		 948 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.719329  normal  0.0833572 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 874 aa  399  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 879 aa  393  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2548  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 1001 aa  379  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  28.33 
 
 		 827 aa  329  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 871 aa  325  3e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 852 aa  317  6e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 869 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 855 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 991 aa  311  5e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 847 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 861 aa  308  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 861 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 849 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 861 aa  303  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 861 aa  302  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 861 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 861 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 941 aa  300  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 941 aa  300  8e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 941 aa  300  8e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 875 aa  295  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 857 aa  293  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  28.03 
 
 		 834 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1447  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 914 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 913 aa  280  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 890 aa  279  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 890 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 903 aa  273  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 890 aa  273  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  29.46 
 
 		 880 aa  270  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2169  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 1064 aa  268  4e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.576978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 935 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 901 aa  261  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 906 aa  260  8e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1705  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 906 aa  260  8e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 906 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 867 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 867 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 904 aa  252  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 867 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 867 aa  251  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 910 aa  251  6e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  27.34 
 
 		 877 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 953 aa  249  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 907 aa  248  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 944 aa  248  4.9999999999999997e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 884 aa  247  6.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 907 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 956 aa  244  7e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 975 aa  242  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 937 aa  241  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 930 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 901 aa  239  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 952 aa  239  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 843 aa  239  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 985 aa  239  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 930 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 930 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 950 aa  238  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  28.06 
 
 		 936 aa  237  9e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  29.42 
 
 		 839 aa  237  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 935 aa  235  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 935 aa  235  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 935 aa  235  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  26.37 
 
 		 866 aa  234  6e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 966 aa  231  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 924 aa  231  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  28.28 
 
 		 966 aa  230  8e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 841 aa  230  9e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 894 aa  230  9e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 866 aa  229  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 893 aa  229  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 836 aa  229  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 855 aa  229  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 909 aa  225  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 933 aa  224  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  25.68 
 
 		 899 aa  224  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 869 aa  223  9e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 855 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 842 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 912 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 909 aa  221  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 974 aa  219  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 838 aa  219  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1939  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 854 aa  219  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246541 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 987 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 981 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 896 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2871  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 935 aa  216  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  25.86 
 
 		 895 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 876 aa  213  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 944 aa  210  9e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 965 aa  209  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 873 aa  209  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 951 aa  209  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 908 aa  209  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>