More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2994 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  50.8 
 
 		 893 aa  829    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1447  TonB-dependent receptor  96.72 
 
 		 914 aa  1749    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  53.53 
 
 		 903 aa  931    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  51.62 
 
 		 935 aa  850    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 913 aa  1858    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  57.49 
 
 		 941 aa  1026    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  57.14 
 
 		 941 aa  1028    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  77.35 
 
 		 906 aa  1423    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  77.35 
 
 		 906 aa  1419    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1705  TonB-dependent receptor  77.35 
 
 		 906 aa  1423    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  57.14 
 
 		 941 aa  1028    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  35.67 
 
 		 879 aa  483  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  35.58 
 
 		 874 aa  472  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  30.7 
 
 		 827 aa  332  3e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 927 aa  296  1e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 928 aa  293  1e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 852 aa  280  6e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3922  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 948 aa  280  7e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.719329  normal  0.0833572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 884 aa  278  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 849 aa  269  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  27.68 
 
 		 834 aa  266  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 861 aa  265  4e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 861 aa  265  4e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 861 aa  265  4e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 869 aa  262  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  28.38 
 
 		 880 aa  262  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 901 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 861 aa  259  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 861 aa  258  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 904 aa  258  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 861 aa  258  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 871 aa  256  9e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 944 aa  256  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 855 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  28.3 
 
 		 877 aa  252  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 857 aa  252  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 891 aa  250  9e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 875 aa  243  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 950 aa  241  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 847 aa  239  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2548  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 1001 aa  236  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 953 aa  235  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 909 aa  226  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 890 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 890 aa  222  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 867 aa  222  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 867 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 867 aa  221  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 890 aa  220  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  27.71 
 
 		 866 aa  220  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 882 aa  218  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 910 aa  218  5e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 843 aa  218  5e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 867 aa  218  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 909 aa  217  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 886 aa  217  9e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 886 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 882 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1939  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 854 aa  214  7e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246541 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2169  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 1064 aa  213  9e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.576978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 892 aa  213  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 896 aa  213  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 866 aa  209  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 1055 aa  208  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 868 aa  207  8e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 956 aa  205  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 872 aa  204  7e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 838 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 841 aa  201  6e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 894 aa  200  9e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 869 aa  197  7e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  26.42 
 
 		 853 aa  197  9e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  25.36 
 
 		 896 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 908 aa  196  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 930 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 894 aa  195  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 930 aa  195  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 930 aa  195  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 991 aa  195  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 869 aa  195  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 817 aa  193  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2693  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 1006 aa  193  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 855 aa  193  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 855 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 873 aa  192  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  26.67 
 
 		 839 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 952 aa  191  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 876 aa  191  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 935 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 897 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 935 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 935 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 901 aa  186  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 924 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 944 aa  186  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 924 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 924 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 925 aa  185  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 836 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 907 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>