More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1705 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  53.56 
 
 
941 aa  964    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  54 
 
 
903 aa  905    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  50 
 
 
935 aa  838    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  77.35 
 
 
913 aa  1423    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  48.05 
 
 
893 aa  778    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  99.45 
 
 
906 aa  1836    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  53.47 
 
 
941 aa  964    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  100 
 
 
906 aa  1843    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1447  TonB-dependent receptor  77.6 
 
 
914 aa  1427    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1705  TonB-dependent receptor  100 
 
 
906 aa  1843    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  53.47 
 
 
941 aa  964    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  35.48 
 
 
874 aa  490  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  35.5 
 
 
879 aa  474  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  30.29 
 
 
827 aa  334  5e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  30.56 
 
 
880 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 
901 aa  288  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3922  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 
948 aa  285  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.719329  normal  0.0833572 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 
927 aa  284  4.0000000000000003e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 
884 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  29.69 
 
 
904 aa  278  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  29.77 
 
 
877 aa  278  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 
928 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 
852 aa  273  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  27.69 
 
 
834 aa  269  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 
871 aa  261  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 
855 aa  261  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 
861 aa  259  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 
861 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 
861 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 
861 aa  257  9e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 
891 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 
861 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 
849 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 
944 aa  256  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 
861 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 
857 aa  251  4e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 
882 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 
882 aa  249  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 
892 aa  248  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 
875 aa  248  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2548  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 
1001 aa  247  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 
886 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 
953 aa  242  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 
886 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 
869 aa  241  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 
847 aa  241  5.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 
890 aa  238  4e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 
890 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2169  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 
1064 aa  232  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.576978  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 
890 aa  230  7e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 
843 aa  226  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 
909 aa  224  6e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 
909 aa  224  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  26.5 
 
 
866 aa  218  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 
894 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 
952 aa  215  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 
868 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 
894 aa  214  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 
867 aa  214  7e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 
950 aa  213  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 
867 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 
867 aa  213  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 
867 aa  211  6e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 
901 aa  209  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  26.04 
 
 
884 aa  208  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 
896 aa  208  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 
855 aa  207  7e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 
975 aa  207  9e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 
855 aa  206  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 
883 aa  206  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 
836 aa  204  7e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 
872 aa  204  8e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 
883 aa  204  9e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 
883 aa  204  9e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1939  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 
854 aa  203  9e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 
935 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 
925 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 
935 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 
935 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 
930 aa  201  6e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 
869 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 
910 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  24.49 
 
 
922 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 
924 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 
924 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 
924 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 
876 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 
956 aa  198  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 
930 aa  199  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 
930 aa  199  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1120  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 
942 aa  197  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00264761 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 
935 aa  197  8.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 
869 aa  197  9e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 
817 aa  197  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 
987 aa  196  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 
924 aa  195  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 
866 aa  195  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 
1055 aa  192  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 
966 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 
873 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>