More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0250 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  45.01 
 
 		 974 aa  784    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 952 aa  1962    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  40.56 
 
 		 981 aa  685    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  40.44 
 
 		 987 aa  687    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  44.56 
 
 		 985 aa  803    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  47.83 
 
 		 975 aa  858    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  44.34 
 
 		 944 aa  808    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 		 953 aa  465  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  33.4 
 
 		 935 aa  445  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 930 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 930 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 930 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 935 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 935 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 935 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 966 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 937 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  32.6 
 
 		 1088 aa  415  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 933 aa  412  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  30.72 
 
 		 936 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 981 aa  398  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 965 aa  389  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 869 aa  388  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  32.03 
 
 		 966 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  29.75 
 
 		 914 aa  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 873 aa  364  5.0000000000000005e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 907 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 897 aa  355  2.9999999999999997e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 907 aa  354  5e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 873 aa  353  7e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 924 aa  341  5e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 853 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 853 aa  340  8e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 841 aa  340  8e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 853 aa  340  8e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 904 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 855 aa  335  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 904 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 838 aa  335  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 843 aa  335  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 904 aa  334  5e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 904 aa  331  4e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 855 aa  330  9e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 944 aa  327  5e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 935 aa  325  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  29.37 
 
 		 853 aa  324  4e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 951 aa  323  8e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 853 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  33.2 
 
 		 901 aa  320  1e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 842 aa  317  8e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 951 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 957 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 966 aa  313  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 836 aa  311  5e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  28.78 
 
 		 839 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 940 aa  308  3e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 912 aa  297  5e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 938 aa  292  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 946 aa  290  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 1007 aa  289  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 969 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 817 aa  288  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  30.22 
 
 		 709 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 947 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 891 aa  283  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 869 aa  281  6e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 1007 aa  281  6e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 1007 aa  280  7e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 861 aa  274  7e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 861 aa  274  7e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 861 aa  273  9e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.92 
 
 		 969 aa  272  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  27.31 
 
 		 1007 aa  272  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 857 aa  271  5.9999999999999995e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 910 aa  270  8.999999999999999e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 872 aa  266  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 964 aa  266  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 852 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 861 aa  265  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 982 aa  265  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 861 aa  264  6e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 861 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 871 aa  262  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 847 aa  259  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 920 aa  254  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 875 aa  254  6e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 849 aa  252  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 927 aa  249  1e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2508  TonB-dependent receptor, plug  26.21 
 
 		 1015 aa  247  6e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.636231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 909 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 924 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 924 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 924 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 928 aa  245  3.9999999999999997e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 939 aa  241  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  26.26 
 
 		 827 aa  240  6.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 944 aa  239  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 896 aa  239  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 901 aa  239  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  28.53 
 
 		 880 aa  239  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>