More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1958 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  50.35 
 
 		 817 aa  779    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  67.87 
 
 		 836 aa  1173    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  96.01 
 
 		 853 aa  1660    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  93.32 
 
 		 853 aa  1640    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  69.28 
 
 		 839 aa  1181    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  81.15 
 
 		 838 aa  1385    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  72.63 
 
 		 843 aa  1246    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  72.01 
 
 		 841 aa  1222    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  80.51 
 
 		 709 aa  1068    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  93.2 
 
 		 853 aa  1637    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  79.63 
 
 		 855 aa  1369    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  79.52 
 
 		 855 aa  1345    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  68.62 
 
 		 842 aa  1165    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  93.2 
 
 		 853 aa  1637    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 853 aa  1738    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  40.79 
 
 		 869 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  40.02 
 
 		 873 aa  554  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  39.07 
 
 		 873 aa  551  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  35.21 
 
 		 933 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  33.74 
 
 		 930 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  33.97 
 
 		 937 aa  452  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 		 930 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 		 930 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  34.63 
 
 		 965 aa  436  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  33.41 
 
 		 935 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  33.41 
 
 		 935 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  33.41 
 
 		 935 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  33.08 
 
 		 936 aa  419  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  33.26 
 
 		 935 aa  417  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  33.84 
 
 		 904 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  33.97 
 
 		 904 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  33.56 
 
 		 904 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  33.67 
 
 		 904 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 981 aa  379  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 897 aa  379  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 907 aa  379  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 966 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 907 aa  362  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 		 924 aa  359  9.999999999999999e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 		 901 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  30.17 
 
 		 966 aa  344  5e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 944 aa  333  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 938 aa  320  7e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 952 aa  320  7.999999999999999e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 891 aa  320  9e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 872 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 974 aa  310  6.999999999999999e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 953 aa  309  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 912 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 966 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 935 aa  299  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 869 aa  294  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 890 aa  294  5e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 975 aa  292  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 948 aa  292  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 890 aa  291  3e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 946 aa  289  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 890 aa  289  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 957 aa  286  8e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 871 aa  285  3.0000000000000004e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 909 aa  283  9e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 1088 aa  283  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 896 aa  283  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 852 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 985 aa  278  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 966 aa  278  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 909 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 951 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 924 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 924 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 924 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 987 aa  275  4.0000000000000004e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 910 aa  273  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 866 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  28.87 
 
 		 929 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 951 aa  268  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 882 aa  267  8e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  28.61 
 
 		 827 aa  266  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 876 aa  266  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 882 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 875 aa  264  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 886 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 981 aa  262  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 964 aa  261  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 867 aa  261  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 886 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 867 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 867 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 969 aa  258  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  27.3 
 
 		 961 aa  256  9e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 867 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 1040 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  29.31 
 
 		 880 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 869 aa  254  6e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 894 aa  253  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 892 aa  253  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  27.53 
 
 		 922 aa  250  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 		 896 aa  249  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 894 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 976 aa  247  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>