More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2411 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  45.51 
 
 		 904 aa  776    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 901 aa  1826    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  45.73 
 
 		 904 aa  781    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  45.85 
 
 		 904 aa  789    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  67.18 
 
 		 897 aa  1222    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  46.06 
 
 		 904 aa  789    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  34.27 
 
 		 869 aa  459  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  33.3 
 
 		 873 aa  431  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  33.41 
 
 		 873 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 907 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 		 981 aa  424  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  33.26 
 
 		 907 aa  426  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  32.53 
 
 		 935 aa  404  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 		 836 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  33.37 
 
 		 953 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  31.75 
 
 		 855 aa  389  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 935 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 935 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 843 aa  386  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  31.98 
 
 		 855 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 935 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  32.15 
 
 		 930 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 930 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 933 aa  378  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 930 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 924 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  32.51 
 
 		 936 aa  375  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  31.75 
 
 		 842 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 841 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 		 937 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  32.47 
 
 		 839 aa  375  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  31.51 
 
 		 853 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 		 853 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 		 853 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 		 853 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  31.62 
 
 		 853 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 965 aa  366  1e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  31.24 
 
 		 838 aa  363  7.0000000000000005e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 817 aa  361  3e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 976 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 935 aa  345  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 912 aa  341  4e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 976 aa  333  6e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  28.24 
 
 		 966 aa  325  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 952 aa  320  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 1088 aa  317  6e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 966 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2379  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 1034 aa  313  5.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0591037  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 944 aa  313  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 966 aa  312  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  34.36 
 
 		 709 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 981 aa  311  5e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 985 aa  308  3e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  28.41 
 
 		 929 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 944 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  29.84 
 
 		 914 aa  302  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 951 aa  300  7e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 938 aa  298  4e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 975 aa  296  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 1020 aa  295  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 998 aa  294  4e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 946 aa  294  4e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 910 aa  293  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 957 aa  292  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 966 aa  291  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 		 974 aa  291  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 987 aa  290  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 1040 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 920 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 947 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 951 aa  283  9e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 922 aa  283  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 849 aa  280  8e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  28.61 
 
 		 961 aa  278  4e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 855 aa  278  5e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 967 aa  275  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 948 aa  273  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 969 aa  271  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 939 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 871 aa  266  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 852 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 847 aa  263  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 857 aa  261  4e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2508  TonB-dependent receptor, plug  27.81 
 
 		 1015 aa  261  4e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.636231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 861 aa  259  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 982 aa  259  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 861 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 861 aa  258  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 914 aa  257  8e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 940 aa  254  7e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 861 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 861 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 861 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 1007 aa  247  8e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 869 aa  241  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 892 aa  239  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1368  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 958 aa  239  1e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000266767  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 1007 aa  239  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 1015 aa  238  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 1007 aa  238  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>