More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2653 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  40.97 
 
 		 929 aa  662    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1368  TonB-dependent receptor  41.17 
 
 		 958 aa  730    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000266767  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 948 aa  1952    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  39.88 
 
 		 966 aa  639    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1437  TonB-dependent receptor  41.17 
 
 		 958 aa  729    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.15469  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  37.31 
 
 		 1040 aa  593  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.6 
 
 		 969 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 		 907 aa  399  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  31.53 
 
 		 961 aa  397  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 		 907 aa  378  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 924 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 938 aa  366  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 965 aa  362  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 966 aa  361  4e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 1020 aa  351  3e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 935 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 935 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 935 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  29.73 
 
 		 936 aa  346  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 930 aa  346  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 930 aa  345  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 930 aa  345  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 869 aa  342  2.9999999999999998e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 935 aa  335  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 951 aa  330  7e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 937 aa  327  8.000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 935 aa  323  9.000000000000001e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 966 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 933 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 957 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 969 aa  318  4e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 951 aa  317  5e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 912 aa  317  8e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 873 aa  313  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 873 aa  311  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  29.15 
 
 		 966 aa  311  5e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 939 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 944 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 947 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 897 aa  302  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 976 aa  298  5e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 853 aa  292  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 914 aa  291  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 857 aa  291  4e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 869 aa  291  5.0000000000000004e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 981 aa  289  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 838 aa  287  5e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 847 aa  287  8e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 852 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 861 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 843 aa  285  4.0000000000000003e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 861 aa  284  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 861 aa  284  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 910 aa  283  9e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 841 aa  282  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 940 aa  280  8e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  28.45 
 
 		 853 aa  280  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 855 aa  280  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 875 aa  278  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 853 aa  278  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 853 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 853 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 861 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 861 aa  274  6e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 861 aa  274  6e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 855 aa  273  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 976 aa  271  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 953 aa  271  4e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 882 aa  271  5e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 901 aa  271  5.9999999999999995e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 998 aa  270  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 836 aa  269  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 894 aa  269  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 882 aa  269  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 842 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 876 aa  266  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  27.38 
 
 		 839 aa  266  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 849 aa  265  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 904 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 886 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 964 aa  263  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 855 aa  262  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 886 aa  261  4e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 904 aa  259  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 904 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 904 aa  257  8e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 1028 aa  257  8e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 817 aa  255  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 924 aa  253  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 924 aa  253  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 924 aa  253  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 892 aa  253  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 1009 aa  247  6e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 883 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  27.64 
 
 		 884 aa  243  9e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 883 aa  243  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 883 aa  243  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 891 aa  240  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 1015 aa  240  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 1007 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>