More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2355 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  46.14 
 
 		 904 aa  801    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  67.88 
 
 		 901 aa  1214    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  45.96 
 
 		 904 aa  792    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  45.96 
 
 		 904 aa  787    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  46.31 
 
 		 904 aa  796    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 897 aa  1825    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  36.14 
 
 		 869 aa  514  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  35.27 
 
 		 907 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  33.91 
 
 		 873 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 873 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  33.8 
 
 		 907 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  33.47 
 
 		 935 aa  441  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 981 aa  435  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  33.37 
 
 		 965 aa  415  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  33.16 
 
 		 953 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 855 aa  405  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 		 924 aa  399  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 		 836 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  32.94 
 
 		 855 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 		 853 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  31.73 
 
 		 966 aa  389  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 		 838 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 843 aa  389  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 853 aa  389  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 		 853 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 		 853 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 841 aa  383  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  31.86 
 
 		 853 aa  382  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  31.79 
 
 		 839 aa  382  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 842 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 912 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 930 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 817 aa  372  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 930 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 930 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 935 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 935 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 935 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 933 aa  368  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 937 aa  369  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  30.47 
 
 		 936 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  32.07 
 
 		 935 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 952 aa  352  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 938 aa  347  5e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 944 aa  341  2.9999999999999998e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 944 aa  340  5e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 		 976 aa  338  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 946 aa  336  1e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 975 aa  332  2e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 966 aa  330  7e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 1088 aa  327  6e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 976 aa  327  8.000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 		 985 aa  325  3e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 951 aa  324  6e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 947 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 966 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 987 aa  318  3e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 981 aa  312  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 974 aa  313  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 957 aa  310  9e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 951 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  28.46 
 
 		 914 aa  305  3.0000000000000004e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 948 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 967 aa  303  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  31.82 
 
 		 709 aa  303  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  28.35 
 
 		 929 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 910 aa  296  8e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  29.48 
 
 		 961 aa  293  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2379  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 1034 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0591037  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 966 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 920 aa  284  6.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 852 aa  283  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 1040 aa  283  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 939 aa  281  4e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 1020 aa  277  6e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 869 aa  277  7e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 871 aa  277  8e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 982 aa  277  8e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 855 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 940 aa  275  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.34 
 
 		 969 aa  273  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 969 aa  269  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 857 aa  265  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 1007 aa  264  6.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 847 aa  263  8e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 998 aa  263  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 861 aa  263  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 861 aa  262  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 861 aa  262  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 861 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 861 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 1015 aa  261  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 861 aa  261  4e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 891 aa  259  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  27.38 
 
 		 1007 aa  258  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1368  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 958 aa  257  6e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000266767  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 922 aa  257  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 849 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3783  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 987 aa  256  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272324 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1437  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 958 aa  255  3e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.15469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>