More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3783 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3783  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 987 aa  1994    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272324 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  33.67 
 
 		 922 aa  423  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 939 aa  413  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 920 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 1000 aa  341  5e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2400  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 1004 aa  309  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 946 aa  280  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 944 aa  273  9e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 935 aa  273  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 897 aa  269  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 947 aa  269  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 976 aa  261  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 1028 aa  253  9.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1228  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 1057 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0919786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 1015 aa  235  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 951 aa  235  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  26.56 
 
 		 1007 aa  235  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 969 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 1007 aa  232  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 1007 aa  233  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 1009 aa  231  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 901 aa  229  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 948 aa  229  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  27.13 
 
 		 966 aa  226  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 976 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0591  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 1032 aa  220  8.999999999999998e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.880997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 981 aa  219  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 967 aa  214  7.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 953 aa  210  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  25.74 
 
 		 961 aa  192  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 933 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 924 aa  191  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 937 aa  190  9e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 956 aa  182  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 957 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 1020 aa  180  9e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  22.28 
 
 		 964 aa  179  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1677  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 1041 aa  179  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1752  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 1041 aa  173  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0957088  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 1055 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 966 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 1007 aa  163  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 893 aa  160  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 951 aa  156  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 952 aa  153  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 869 aa  152  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  30.62 
 
 		 987 aa  151  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 940 aa  145  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 981 aa  144  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3289  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 924 aa  142  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 935 aa  141  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 935 aa  141  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 935 aa  141  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 909 aa  141  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 904 aa  141  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 904 aa  140  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 904 aa  140  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 935 aa  140  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  25.08 
 
 		 936 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02110  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 824 aa  139  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806271  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 904 aa  138  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 903 aa  137  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  38.91 
 
 		 836 aa  137  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 873 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 965 aa  134  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 873 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 998 aa  132  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  37.93 
 
 		 938 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  39.39 
 
 		 855 aa  132  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 930 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 930 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 930 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 914 aa  131  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  24.27 
 
 		 914 aa  131  8.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 907 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  38.67 
 
 		 841 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 894 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 975 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  38.52 
 
 		 843 aa  129  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  24.41 
 
 		 834 aa  127  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 985 aa  127  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  39.02 
 
 		 855 aa  125  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  39.41 
 
 		 853 aa  124  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 838 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  40.96 
 
 		 969 aa  124  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 912 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  36.73 
 
 		 910 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 974 aa  122  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  38.46 
 
 		 709 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  39.55 
 
 		 1040 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  25.18 
 
 		 853 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  32.54 
 
 		 907 aa  118  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  38.14 
 
 		 853 aa  118  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 853 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 853 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  36.22 
 
 		 839 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 982 aa  117  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  35.04 
 
 		 869 aa  115  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2548  TonB-dependent receptor  38.72 
 
 		 1001 aa  115  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  36.25 
 
 		 817 aa  114  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>