More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1228 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1228  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1057 aa  2129    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0919786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 951 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 		 966 aa  459  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 946 aa  444  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 957 aa  434  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 		 967 aa  412  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 947 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  31.63 
 
 		 1028 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 969 aa  382  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 951 aa  322  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 976 aa  311  5.9999999999999995e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0591  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 1032 aa  310  9e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.880997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 935 aa  308  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 922 aa  291  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 1015 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1677  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 1041 aa  280  1e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1752  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 1041 aa  274  8.000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0957088  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.18 
 
 		 969 aa  272  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02110  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 824 aa  268  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806271  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  26.45 
 
 		 966 aa  240  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2400  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 1004 aa  239  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3783  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 987 aa  237  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 1000 aa  226  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 966 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 944 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 935 aa  214  7e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 935 aa  214  7e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 935 aa  214  7e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 937 aa  214  9e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 933 aa  214  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 920 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 897 aa  195  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 901 aa  187  7e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 924 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 924 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 924 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  26.22 
 
 		 1007 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 1007 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 1007 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 1007 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 904 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 938 aa  173  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 904 aa  171  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 939 aa  170  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 904 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 1040 aa  169  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 904 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 873 aa  163  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 1009 aa  161  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 940 aa  160  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 1020 aa  160  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 873 aa  159  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 952 aa  159  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1769  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 985 aa  157  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 965 aa  156  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 966 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 975 aa  154  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 935 aa  153  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 981 aa  154  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 914 aa  151  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  28.7 
 
 		 929 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2508  TonB-dependent receptor, plug  26.4 
 
 		 1015 aa  149  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.636231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 976 aa  148  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 964 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 981 aa  147  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 		 987 aa  145  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 974 aa  143  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 950 aa  141  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 1055 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 924 aa  136  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  27.21 
 
 		 985 aa  135  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  36.97 
 
 		 907 aa  135  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  36.15 
 
 		 948 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 982 aa  134  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 944 aa  132  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  40.69 
 
 		 842 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  42.27 
 
 		 998 aa  131  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  40.98 
 
 		 836 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  37.9 
 
 		 817 aa  130  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  36.73 
 
 		 869 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  38.82 
 
 		 855 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 930 aa  129  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 930 aa  129  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 930 aa  129  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  36.13 
 
 		 843 aa  128  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  37.55 
 
 		 853 aa  127  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  37.13 
 
 		 709 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  41.88 
 
 		 961 aa  126  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  39.47 
 
 		 838 aa  125  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  37.13 
 
 		 853 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  37.13 
 
 		 853 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  37.13 
 
 		 853 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  37.23 
 
 		 841 aa  124  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  37.45 
 
 		 839 aa  124  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  24.92 
 
 		 936 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  40.93 
 
 		 855 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  40.1 
 
 		 853 aa  122  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  38.79 
 
 		 867 aa  122  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 910 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1455  TonB-dependent receptor, plug  24.63 
 
 		 1040 aa  121  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212874  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>