More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2548 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3922  TonB-dependent receptor  40.48 
 
 		 948 aa  662    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.719329  normal  0.0833572 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2548  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1001 aa  2041    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2169  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 1064 aa  479  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.576978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 927 aa  389  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 928 aa  384  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 944 aa  378  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 874 aa  282  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 879 aa  264  6e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 875 aa  242  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 941 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 941 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 855 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 941 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 869 aa  230  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 906 aa  229  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 906 aa  229  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1705  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 906 aa  229  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278713  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 871 aa  226  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 847 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 861 aa  222  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1447  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 914 aa  221  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 861 aa  220  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 861 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 861 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 861 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 903 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 913 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 861 aa  218  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 852 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 935 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 904 aa  213  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  26.06 
 
 		 877 aa  209  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 857 aa  205  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 956 aa  204  6e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 893 aa  202  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 937 aa  201  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 901 aa  200  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 976 aa  194  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 909 aa  194  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  24.98 
 
 		 884 aa  194  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 981 aa  193  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 904 aa  194  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 953 aa  189  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 904 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 904 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 933 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  24.98 
 
 		 904 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0703  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 954 aa  184  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917927 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 957 aa  184  7e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 935 aa  183  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 935 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 853 aa  182  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 920 aa  182  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  24.26 
 
 		 853 aa  178  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 843 aa  177  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 872 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 951 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  24.83 
 
 		 853 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  24.49 
 
 		 895 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 924 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  24.63 
 
 		 853 aa  173  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 924 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 924 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  24.63 
 
 		 853 aa  173  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 901 aa  171  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 907 aa  171  6e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 939 aa  170  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 836 aa  170  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 924 aa  169  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 1020 aa  167  8e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  24.98 
 
 		 944 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 969 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  26.59 
 
 		 966 aa  164  8.000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  26.31 
 
 		 709 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 976 aa  163  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 966 aa  162  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03827  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 892 aa  161  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 855 aa  157  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1939  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 854 aa  156  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246541 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 981 aa  155  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 855 aa  155  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 966 aa  153  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 947 aa  150  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2400  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 1004 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 1015 aa  149  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  46.47 
 
 		 827 aa  149  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.87 
 
 		 969 aa  147  9e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 1007 aa  147  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 946 aa  145  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2693  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 1006 aa  144  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1120  TonB-dependent receptor  38.59 
 
 		 942 aa  144  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264761 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  25.58 
 
 		 961 aa  142  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 940 aa  142  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  37.6 
 
 		 834 aa  140  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 935 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 935 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 935 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  39.41 
 
 		 869 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  40.48 
 
 		 873 aa  135  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  34.8 
 
 		 880 aa  135  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>