More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2693 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  38.85 
 
 		 950 aa  640    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2693  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1006 aa  2038    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  39.86 
 
 		 1055 aa  635  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1455  TonB-dependent receptor, plug  33.89 
 
 		 1040 aa  483  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 875 aa  280  8e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  27.25 
 
 		 827 aa  278  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 869 aa  266  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 957 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 849 aa  257  6e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 874 aa  257  6e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 910 aa  254  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 852 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 861 aa  250  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 861 aa  249  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 861 aa  248  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 894 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 951 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 966 aa  244  5e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 869 aa  244  7.999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 867 aa  241  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 867 aa  240  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  27.14 
 
 		 880 aa  239  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 956 aa  239  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 867 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 867 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 937 aa  233  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 901 aa  231  4e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 944 aa  231  5e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 879 aa  229  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 925 aa  229  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 884 aa  228  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 946 aa  226  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 891 aa  224  8e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 869 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 896 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  24.98 
 
 		 907 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 866 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 947 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 944 aa  219  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 933 aa  218  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  25.27 
 
 		 922 aa  218  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  25.97 
 
 		 884 aa  217  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 890 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 927 aa  215  3.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 890 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  24.68 
 
 		 877 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 928 aa  213  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 935 aa  212  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 935 aa  212  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 935 aa  212  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 948 aa  211  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 873 aa  210  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 890 aa  210  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 873 aa  208  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 930 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 930 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 924 aa  205  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 930 aa  205  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 941 aa  202  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 876 aa  202  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 941 aa  202  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 941 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 909 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 904 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 909 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  25.78 
 
 		 899 aa  198  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 913 aa  196  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 892 aa  195  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1447  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 914 aa  195  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 904 aa  194  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 904 aa  194  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 904 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 935 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  26.22 
 
 		 896 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 966 aa  191  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 872 aa  190  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 924 aa  187  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 924 aa  187  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 924 aa  187  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 938 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0703  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 954 aa  187  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917927 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  25.17 
 
 		 895 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  24.28 
 
 		 974 aa  184  8.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 871 aa  183  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 868 aa  184  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 1040 aa  183  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  23.97 
 
 		 893 aa  182  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 969 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 981 aa  182  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 1028 aa  182  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 901 aa  180  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 944 aa  179  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 1009 aa  178  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 951 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 855 aa  173  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 847 aa  172  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 940 aa  172  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 976 aa  172  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 906 aa  171  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 906 aa  170  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>