More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1455 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1455  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 1040 aa  2102    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  35.19 
 
 		 950 aa  496  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2693  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 		 1006 aa  473  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 1055 aa  433  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 852 aa  273  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 861 aa  266  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 861 aa  266  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 861 aa  265  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 861 aa  264  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 861 aa  264  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 861 aa  264  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 855 aa  259  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 857 aa  259  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 849 aa  248  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 871 aa  249  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 847 aa  247  8e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 875 aa  213  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 874 aa  209  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 953 aa  190  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 879 aa  184  8.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 981 aa  169  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3289  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 924 aa  168  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0703  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 954 aa  168  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917927 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 894 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 930 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 930 aa  164  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 930 aa  164  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 944 aa  163  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1120  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 942 aa  162  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264761 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  24.39 
 
 		 936 aa  161  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 991 aa  160  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 935 aa  160  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 935 aa  160  9e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 935 aa  160  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 937 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 904 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 904 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  22.1 
 
 		 892 aa  152  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 906 aa  151  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 935 aa  151  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 906 aa  151  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1705  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 906 aa  151  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278713  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 933 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 909 aa  148  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 894 aa  148  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 913 aa  147  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  23.87 
 
 		 914 aa  145  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 903 aa  145  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  22.79 
 
 		 893 aa  144  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 976 aa  142  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 909 aa  140  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 957 aa  139  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 867 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 867 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 867 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 867 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 998 aa  132  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 869 aa  132  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 948 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 941 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 941 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 901 aa  130  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 982 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 941 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 866 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 956 aa  125  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 876 aa  125  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1228  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 1057 aa  125  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0919786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  24.44 
 
 		 961 aa  125  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  23.7 
 
 		 966 aa  124  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  22.86 
 
 		 827 aa  124  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2548  TonB-dependent receptor  22.58 
 
 		 1001 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 868 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 869 aa  118  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  24.16 
 
 		 880 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 1020 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  21.78 
 
 		 987 aa  113  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 944 aa  113  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 838 aa  112  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2026  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 1068 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00076043  normal  0.701552 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  22.56 
 
 		 912 aa  112  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 901 aa  110  9.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 924 aa  110  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  23.37 
 
 		 985 aa  110  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 843 aa  110  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  23.06 
 
 		 969 aa  110  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  32.33 
 
 		 922 aa  109  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 891 aa  109  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  36.52 
 
 		 964 aa  108  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 976 aa  108  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  35.84 
 
 		 873 aa  108  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 925 aa  108  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  22.62 
 
 		 935 aa  107  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 975 aa  107  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  35.4 
 
 		 873 aa  106  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4016  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 1015 aa  106  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  36.77 
 
 		 935 aa  106  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  29.87 
 
 		 853 aa  105  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  35.15 
 
 		 907 aa  105  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  34.47 
 
 		 884 aa  104  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>