More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4016 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4016  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1015 aa  2069    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2660  TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 979 aa  410  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.436942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 901 aa  195  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 894 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3289  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 924 aa  191  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 1055 aa  164  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 924 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 924 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 924 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 907 aa  154  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 907 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 924 aa  144  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  23.4 
 
 		 884 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 875 aa  139  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 950 aa  140  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 		 869 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  22.9 
 
 		 883 aa  135  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  37.84 
 
 		 912 aa  135  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  24.38 
 
 		 974 aa  133  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  22.23 
 
 		 944 aa  132  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 975 aa  130  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.01 
 
 		 969 aa  128  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  24.15 
 
 		 985 aa  124  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  37.05 
 
 		 899 aa  118  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 965 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 930 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 930 aa  116  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 930 aa  116  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  22.96 
 
 		 969 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 842 aa  114  9e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  22.6 
 
 		 956 aa  113  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2548  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 1001 aa  112  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  36.62 
 
 		 991 aa  112  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 891 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 981 aa  111  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 879 aa  111  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  33.88 
 
 		 880 aa  111  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  33.2 
 
 		 952 aa  110  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 904 aa  108  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 981 aa  108  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 882 aa  107  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  33.87 
 
 		 884 aa  107  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 897 aa  107  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 882 aa  107  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 953 aa  106  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  34.86 
 
 		 904 aa  107  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  37.87 
 
 		 976 aa  107  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 904 aa  107  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1455  TonB-dependent receptor, plug  32.43 
 
 		 1040 aa  106  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 987 aa  106  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 904 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 		 904 aa  106  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 920 aa  106  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  34.4 
 
 		 877 aa  105  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  33.62 
 
 		 834 aa  105  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 935 aa  105  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 935 aa  105  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 935 aa  105  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 935 aa  104  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  35.35 
 
 		 843 aa  104  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  34.1 
 
 		 908 aa  104  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 872 aa  103  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 		 927 aa  103  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 		 895 aa  103  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 886 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 886 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  34.72 
 
 		 901 aa  102  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 928 aa  102  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 841 aa  102  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 892 aa  102  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1228  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 1057 aa  102  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0919786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 966 aa  101  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  34.52 
 
 		 893 aa  101  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  21.98 
 
 		 967 aa  101  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 874 aa  100  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 890 aa  100  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  30.21 
 
 		 922 aa  100  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0703  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 954 aa  99.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917927 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 890 aa  100  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2169  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 1064 aa  99.8  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.576978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 		 883 aa  99  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 		 883 aa  99  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 873 aa  98.6  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  32.83 
 
 		 896 aa  98.6  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  36.06 
 
 		 966 aa  98.6  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  36.7 
 
 		 966 aa  98.2  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 933 aa  98.2  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  31.78 
 
 		 709 aa  98.2  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  33.97 
 
 		 890 aa  97.8  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 896 aa  97.4  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 855 aa  97.8  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  29.57 
 
 		 839 aa  97.4  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 901 aa  96.7  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  35.41 
 
 		 914 aa  96.7  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 937 aa  96.3  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 873 aa  96.3  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  26.55 
 
 		 936 aa  95.5  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 869 aa  95.5  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 853 aa  95.9  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 853 aa  95.9  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>