More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2660 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2660  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 979 aa  1974    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.436942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4016  TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 1015 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 894 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 901 aa  314  4.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 875 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3289  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 924 aa  196  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 842 aa  191  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 843 aa  189  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 836 aa  182  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 855 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  25.88 
 
 		 853 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 841 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 849 aa  180  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 853 aa  180  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  26.07 
 
 		 839 aa  178  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 883 aa  178  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 883 aa  178  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  25.77 
 
 		 853 aa  177  7e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 883 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  25.79 
 
 		 853 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  25.79 
 
 		 853 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 874 aa  174  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 855 aa  174  9e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 857 aa  173  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 838 aa  174  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  25.58 
 
 		 880 aa  174  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 852 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 855 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 847 aa  171  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 907 aa  170  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 904 aa  169  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 861 aa  168  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 861 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  24.98 
 
 		 871 aa  167  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 861 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 861 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 861 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 912 aa  164  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 861 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 924 aa  160  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 950 aa  158  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 1055 aa  156  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 890 aa  156  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 890 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  26.56 
 
 		 709 aa  155  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 890 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 884 aa  153  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 867 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 867 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 867 aa  151  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 867 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 938 aa  149  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 920 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 935 aa  146  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 953 aa  144  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2693  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 1006 aa  144  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 933 aa  144  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 901 aa  144  8e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 817 aa  142  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3032  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 874 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 948 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 935 aa  138  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 909 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  22.79 
 
 		 1020 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 935 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 935 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  25.89 
 
 		 961 aa  135  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 935 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 981 aa  134  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 909 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 952 aa  133  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  22.74 
 
 		 930 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 969 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  22.74 
 
 		 930 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  22.4 
 
 		 951 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 944 aa  129  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  21.79 
 
 		 936 aa  129  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 937 aa  129  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 927 aa  129  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 930 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  23.28 
 
 		 896 aa  125  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  36.89 
 
 		 873 aa  125  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 928 aa  124  8e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 947 aa  124  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  37.87 
 
 		 873 aa  124  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 893 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 879 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  39.06 
 
 		 904 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  39.06 
 
 		 904 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 1088 aa  123  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  24.71 
 
 		 856 aa  123  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  39.06 
 
 		 904 aa  122  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  34.45 
 
 		 907 aa  122  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  39.06 
 
 		 904 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 966 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  33.76 
 
 		 1040 aa  121  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  39.07 
 
 		 897 aa  121  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2379  TonB-dependent receptor  36.84 
 
 		 1034 aa  120  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0591037  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  23.29 
 
 		 893 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  32.27 
 
 		 884 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>