More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3766 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 920 aa  1865    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  39.03 
 
 		 922 aa  567  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  36.88 
 
 		 939 aa  557  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2400  TonB-dependent receptor  33.9 
 
 		 1004 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  32.64 
 
 		 1000 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  33 
 
 		 946 aa  384  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  32.27 
 
 		 951 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3783  TonB-dependent receptor plug  31.2 
 
 		 987 aa  375  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272324 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 947 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 966 aa  361  4e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 951 aa  349  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 957 aa  346  1e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 935 aa  339  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 967 aa  338  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 969 aa  332  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1228  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 1057 aa  332  2e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0919786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 944 aa  324  4e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 976 aa  318  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 998 aa  306  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 976 aa  302  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 1040 aa  299  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 1020 aa  294  4e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 1007 aa  293  9e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 1007 aa  293  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 938 aa  288  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  28.8 
 
 		 1007 aa  287  7e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 1009 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 897 aa  284  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 901 aa  282  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 1007 aa  281  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 966 aa  278  5e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 873 aa  265  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  28.23 
 
 		 929 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 1028 aa  263  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0591  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 1032 aa  259  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.880997  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 940 aa  258  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 873 aa  256  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  27.88 
 
 		 961 aa  254  5.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 952 aa  253  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 937 aa  253  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 935 aa  252  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 935 aa  252  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 935 aa  252  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  29.04 
 
 		 966 aa  247  8e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 855 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 964 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 933 aa  245  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 981 aa  243  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.94 
 
 		 969 aa  243  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  27.73 
 
 		 839 aa  242  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 948 aa  239  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  29.09 
 
 		 936 aa  238  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 817 aa  238  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 855 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 930 aa  235  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 930 aa  235  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 930 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1677  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 1041 aa  229  2e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02110  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 824 aa  228  5.0000000000000005e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806271  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 944 aa  226  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1752  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 1041 aa  222  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0957088  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 1088 aa  219  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 879 aa  211  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 901 aa  206  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  27.69 
 
 		 914 aa  202  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 956 aa  202  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  27.96 
 
 		 827 aa  198  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  26.13 
 
 		 985 aa  197  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 910 aa  196  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 869 aa  191  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 927 aa  191  5.999999999999999e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 950 aa  190  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 843 aa  189  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 875 aa  187  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 904 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 924 aa  185  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 904 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2548  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 1001 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 904 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 904 aa  180  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 1015 aa  179  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 928 aa  179  3e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 965 aa  177  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 975 aa  175  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 852 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 913 aa  171  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 935 aa  171  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 847 aa  170  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1447  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 914 aa  170  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  26.51 
 
 		 884 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 924 aa  168  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 924 aa  168  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 924 aa  168  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  24.74 
 
 		 895 aa  167  9e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 841 aa  167  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 912 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 874 aa  165  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  25.36 
 
 		 896 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 838 aa  163  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 906 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>