More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1677 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1677  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1041 aa  2132    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1752  TonB-dependent receptor  99.04 
 
 		 1041 aa  2113    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0957088  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0591  TonB-dependent receptor  38.04 
 
 		 1032 aa  629  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.880997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 947 aa  308  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 951 aa  308  3e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 957 aa  289  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 966 aa  287  7e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1228  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 1057 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0919786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 969 aa  284  7.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 967 aa  280  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 946 aa  272  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 951 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 944 aa  257  8e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 1028 aa  251  5e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 981 aa  239  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 981 aa  234  7.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 975 aa  233  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02110  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 824 aa  233  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806271  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 1015 aa  233  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.75 
 
 		 969 aa  232  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  26.89 
 
 		 985 aa  230  8e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 976 aa  230  9e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 935 aa  225  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 920 aa  224  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 922 aa  221  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 939 aa  219  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 937 aa  218  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 987 aa  218  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  26.59 
 
 		 936 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 976 aa  213  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 933 aa  211  6e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  25.1 
 
 		 966 aa  204  6e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 907 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 907 aa  192  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 924 aa  190  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 901 aa  188  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 1000 aa  185  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2379  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 1034 aa  177  8e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0591037  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3783  TonB-dependent receptor plug  24.34 
 
 		 987 aa  177  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2400  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 1004 aa  171  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 935 aa  170  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 935 aa  170  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 935 aa  170  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 928 aa  165  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 927 aa  162  4e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 956 aa  161  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 966 aa  159  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 938 aa  157  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2026  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 1068 aa  154  7e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00076043  normal  0.701552 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 875 aa  153  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 974 aa  149  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 904 aa  146  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 930 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 930 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 897 aa  146  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 930 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 965 aa  145  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 935 aa  144  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  23.86 
 
 		 961 aa  143  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 1088 aa  142  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 940 aa  140  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 1007 aa  140  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 952 aa  140  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 904 aa  138  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 912 aa  138  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  26.01 
 
 		 1007 aa  138  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 1007 aa  137  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 1007 aa  137  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 904 aa  137  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 869 aa  135  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 904 aa  135  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 1009 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 924 aa  132  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 924 aa  132  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 982 aa  132  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 924 aa  132  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 953 aa  130  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 944 aa  130  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 869 aa  129  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  36.58 
 
 		 836 aa  129  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 966 aa  122  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  35.04 
 
 		 839 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  36.4 
 
 		 843 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  34.54 
 
 		 853 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  34.54 
 
 		 853 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  35.2 
 
 		 853 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  36.2 
 
 		 841 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  36.1 
 
 		 873 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  35.29 
 
 		 709 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  36.59 
 
 		 873 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2548  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 1001 aa  119  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  34.47 
 
 		 922 aa  118  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  37.68 
 
 		 853 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  38.19 
 
 		 857 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  34.12 
 
 		 855 aa  117  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 853 aa  117  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3922  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 948 aa  115  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.719329  normal  0.0833572 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  41.67 
 
 		 908 aa  114  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  35.27 
 
 		 817 aa  114  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  37.56 
 
 		 838 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>