More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3124 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3124  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 973 aa  1991    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37900  putative TonB-dependent receptor  70.26 
 
 		 846 aa  1236    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00691809  normal  0.333573 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  46.41 
 
 		 908 aa  773    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1120  TonB-dependent receptor  36.91 
 
 		 942 aa  523  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264761 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03827  TonB-dependent receptor  35.95 
 
 		 892 aa  510  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  36.56 
 
 		 912 aa  502  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1769  TonB-dependent receptor  35.48 
 
 		 985 aa  417  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2871  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 935 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  27.97 
 
 		 866 aa  280  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 890 aa  271  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 890 aa  271  5e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 890 aa  269  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  27.66 
 
 		 922 aa  257  9e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 852 aa  225  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 855 aa  224  7e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 879 aa  223  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 874 aa  222  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 861 aa  217  9e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 861 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 872 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 861 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 861 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 861 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 861 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 869 aa  212  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 928 aa  207  7e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 873 aa  207  9e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 867 aa  207  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 867 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 867 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 867 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 869 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 981 aa  197  9e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 873 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 927 aa  196  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  26.44 
 
 		 834 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  24.72 
 
 		 914 aa  190  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 944 aa  189  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  25.96 
 
 		 884 aa  189  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03700  TonB-dependent outer membrane receptor  31.3 
 
 		 532 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 952 aa  186  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  25.55 
 
 		 827 aa  185  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 946 aa  185  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  25.44 
 
 		 880 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 907 aa  184  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 866 aa  183  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 944 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 853 aa  180  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 901 aa  179  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 894 aa  179  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 951 aa  179  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 800 aa  178  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 904 aa  177  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 841 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  27.27 
 
 		 853 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 838 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 904 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 904 aa  174  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 904 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 876 aa  172  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 912 aa  171  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 907 aa  171  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 991 aa  169  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 904 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  25.11 
 
 		 877 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 853 aa  166  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 853 aa  166  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 853 aa  166  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  44.19 
 
 		 899 aa  164  9e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 901 aa  163  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 957 aa  163  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 913 aa  161  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03701  TonB-dependent outer membrane receptor  42.2 
 
 		 311 aa  162  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 		 1015 aa  161  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1132  TonB-dependent receptor plug  25.17 
 
 		 930 aa  161  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.746055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  42.34 
 
 		 895 aa  160  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 884 aa  160  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 953 aa  159  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  41.58 
 
 		 896 aa  159  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 966 aa  158  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  43.07 
 
 		 893 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  35.4 
 
 		 883 aa  154  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 1055 aa  151  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  44.33 
 
 		 925 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 893 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 894 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 950 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 914 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 940 aa  148  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3032  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 874 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  37.23 
 
 		 884 aa  144  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  34.09 
 
 		 896 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 1009 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 981 aa  142  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  39.57 
 
 		 982 aa  139  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2243  TonB-dependent receptor  33.45 
 
 		 1000 aa  139  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 944 aa  139  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2531  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 843 aa  137  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 847 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 966 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>