204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03700 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03700  TonB-dependent outer membrane receptor  100 
 
 		 532 aa  1085    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1769  TonB-dependent receptor  50.82 
 
 		 985 aa  536  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 912 aa  240  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 908 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1120  TonB-dependent receptor  33.68 
 
 		 942 aa  236  9e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264761 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37900  putative TonB-dependent receptor  33.83 
 
 		 846 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00691809  normal  0.333573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3124  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 973 aa  187  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03827  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 892 aa  178  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2871  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 935 aa  147  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 890 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 890 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 890 aa  134  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  27.59 
 
 		 899 aa  124  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  26.96 
 
 		 896 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 882 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 886 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 882 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 894 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 886 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 892 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  25.45 
 
 		 893 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  26.44 
 
 		 895 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 925 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  25.42 
 
 		 866 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  26.72 
 
 		 922 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  27.99 
 
 		 884 aa  101  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 883 aa  100  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 849 aa  97.8  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 981 aa  96.7  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 883 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 883 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 874 aa  95.9  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 924 aa  94  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 924 aa  94  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 924 aa  94  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 879 aa  93.6  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 966 aa  92.8  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  26.05 
 
 		 880 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 869 aa  89.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 847 aa  89  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 867 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 867 aa  88.2  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 891 aa  87.4  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 867 aa  87.4  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 867 aa  87  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 852 aa  87  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 838 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 944 aa  85.9  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  22.31 
 
 		 855 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 836 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 1028 aa  84  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  24.39 
 
 		 827 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 987 aa  83.2  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 871 aa  82  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 1015 aa  82  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3032  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 874 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 901 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  24.51 
 
 		 966 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 1009 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 861 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 872 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 861 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 861 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 861 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 861 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 800 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  24.51 
 
 		 914 aa  78.2  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 907 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 861 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 875 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 896 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 857 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02110  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 824 aa  77.4  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806271  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 935 aa  77  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 935 aa  77  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 935 aa  77  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  23.7 
 
 		 877 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 904 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 1000 aa  77  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  24 
 
 		 936 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 884 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 937 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 904 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  25.38 
 
 		 853 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 907 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 935 aa  75.5  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 947 aa  75.5  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 843 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 853 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 933 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 924 aa  74.3  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 904 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 935 aa  73.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 909 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 901 aa  73.9  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 842 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 952 aa  72.8  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 965 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 944 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 873 aa  72  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>