More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_37900 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3124  TonB-dependent receptor  70.26 
 
 		 973 aa  1233    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  47.64 
 
 		 908 aa  790    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37900  putative TonB-dependent receptor  100 
 
 		 846 aa  1724    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00691809  normal  0.333573 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  37.57 
 
 		 912 aa  540  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03827  TonB-dependent receptor  36.63 
 
 		 892 aa  531  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1120  TonB-dependent receptor  36.98 
 
 		 942 aa  524  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264761 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1769  TonB-dependent receptor  34.54 
 
 		 985 aa  416  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2871  TonB-dependent receptor  32.68 
 
 		 935 aa  415  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  29.68 
 
 		 866 aa  295  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 925 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  27.17 
 
 		 922 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 890 aa  265  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 890 aa  263  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 890 aa  257  8e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 874 aa  230  7e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 879 aa  225  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 872 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 869 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 883 aa  211  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 883 aa  211  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 883 aa  210  8e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03700  TonB-dependent outer membrane receptor  33.83 
 
 		 532 aa  207  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 873 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 867 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 841 aa  195  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 867 aa  194  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 867 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 867 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 928 aa  187  6e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 800 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 876 aa  180  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 944 aa  179  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 927 aa  179  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 907 aa  178  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  24.87 
 
 		 834 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 912 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  26.12 
 
 		 914 aa  172  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 817 aa  172  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 907 aa  170  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 866 aa  170  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03701  TonB-dependent outer membrane receptor  40.98 
 
 		 311 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 855 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 855 aa  168  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 966 aa  168  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 952 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  26.82 
 
 		 880 aa  165  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 951 aa  163  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 894 aa  160  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  26.21 
 
 		 877 aa  157  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  23.06 
 
 		 974 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 1009 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 897 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  46.43 
 
 		 895 aa  151  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 904 aa  150  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  38.98 
 
 		 896 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  47.02 
 
 		 899 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  45.83 
 
 		 893 aa  146  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 981 aa  146  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 901 aa  144  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 940 aa  142  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  34.27 
 
 		 843 aa  139  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  49.7 
 
 		 861 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 891 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  49.7 
 
 		 861 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  49.7 
 
 		 861 aa  138  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  48.5 
 
 		 861 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  48.5 
 
 		 861 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  40 
 
 		 827 aa  137  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  48.5 
 
 		 861 aa  137  8e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  38.74 
 
 		 896 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  41.62 
 
 		 875 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  47.9 
 
 		 852 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  49.1 
 
 		 849 aa  135  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  46.11 
 
 		 857 aa  134  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  45.83 
 
 		 982 aa  134  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  33.57 
 
 		 836 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  47.31 
 
 		 855 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 		 842 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  40.21 
 
 		 869 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  47.31 
 
 		 847 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 935 aa  131  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  43.16 
 
 		 884 aa  129  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  35.09 
 
 		 839 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  42.46 
 
 		 853 aa  128  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  41.67 
 
 		 944 aa  128  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  41.44 
 
 		 873 aa  126  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3922  TonB-dependent receptor  33.9 
 
 		 948 aa  127  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.719329  normal  0.0833572 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 976 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  35.59 
 
 		 709 aa  127  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2508  TonB-dependent receptor, plug  37.24 
 
 		 1015 aa  127  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.636231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  39.68 
 
 		 909 aa  125  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  39.29 
 
 		 853 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  39.29 
 
 		 853 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  39.29 
 
 		 853 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 991 aa  124  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 939 aa  124  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  41.9 
 
 		 838 aa  124  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  46.71 
 
 		 871 aa  124  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  38.1 
 
 		 909 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 		 933 aa  122  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>