More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1769 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1769  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 985 aa  2009    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03700  TonB-dependent outer membrane receptor  50.82 
 
 		 532 aa  536  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  34.06 
 
 		 908 aa  473  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  33.03 
 
 		 912 aa  456  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3124  TonB-dependent receptor  33.13 
 
 		 973 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37900  putative TonB-dependent receptor  32.15 
 
 		 846 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00691809  normal  0.333573 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1120  TonB-dependent receptor  32.18 
 
 		 942 aa  381  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264761 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03827  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 		 892 aa  373  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03701  TonB-dependent outer membrane receptor  60.07 
 
 		 311 aa  375  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2871  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 935 aa  340  8e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 925 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  27.28 
 
 		 895 aa  265  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  29.1 
 
 		 922 aa  262  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  26.97 
 
 		 866 aa  257  6e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 871 aa  223  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 861 aa  218  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 861 aa  218  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 852 aa  217  7e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 861 aa  216  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 861 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 861 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 861 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 855 aa  213  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 981 aa  211  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 869 aa  210  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 952 aa  207  9e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 849 aa  205  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 847 aa  204  6e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 886 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 886 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 857 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 991 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 882 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 874 aa  198  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  26.59 
 
 		 884 aa  197  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 883 aa  197  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 883 aa  196  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 883 aa  196  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 879 aa  194  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  26.9 
 
 		 914 aa  193  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 944 aa  191  8e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 987 aa  189  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 909 aa  189  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 901 aa  183  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 975 aa  182  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 875 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 897 aa  181  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 956 aa  181  7e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 939 aa  181  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 907 aa  181  8e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 951 aa  180  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 910 aa  179  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  25.32 
 
 		 834 aa  179  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 912 aa  177  9e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 800 aa  174  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 924 aa  174  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 951 aa  172  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 946 aa  171  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 907 aa  171  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  40.69 
 
 		 899 aa  171  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  25.99 
 
 		 877 aa  170  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 904 aa  170  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  40.79 
 
 		 890 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 1007 aa  168  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 1007 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  39.91 
 
 		 890 aa  165  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  39.91 
 
 		 890 aa  166  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 873 aa  164  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  39.1 
 
 		 872 aa  162  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  25.32 
 
 		 1007 aa  160  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  39.9 
 
 		 893 aa  160  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  38.21 
 
 		 896 aa  159  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1228  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1057 aa  159  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0919786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 969 aa  159  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  40.74 
 
 		 827 aa  159  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 868 aa  158  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2243  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 1000 aa  155  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 1009 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 1015 aa  153  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  40.71 
 
 		 944 aa  148  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 906 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 836 aa  147  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 906 aa  147  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1705  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 906 aa  147  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278713  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  37.1 
 
 		 953 aa  145  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1437  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 958 aa  142  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.15469  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1368  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 958 aa  140  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000266767  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 976 aa  140  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 893 aa  138  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 950 aa  138  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  38.77 
 
 		 944 aa  137  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 940 aa  137  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  34.63 
 
 		 891 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 914 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  32.6 
 
 		 896 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  37.13 
 
 		 909 aa  135  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  37.55 
 
 		 928 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  38.72 
 
 		 867 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  37.55 
 
 		 927 aa  133  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  36.18 
 
 		 982 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>