More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4293 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  46.23 
 
 		 981 aa  854    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4293  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 973 aa  1947    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  0.297709 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 966 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 965 aa  354  4e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  31.62 
 
 		 966 aa  351  5e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 935 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 935 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 935 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  29.79 
 
 		 936 aa  330  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 937 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 930 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 930 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 930 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 933 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 953 aa  311  2.9999999999999997e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 935 aa  305  3.0000000000000004e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 1088 aa  291  5.0000000000000004e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 		 897 aa  285  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 981 aa  279  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 869 aa  277  6e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 907 aa  273  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 904 aa  272  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 987 aa  272  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 904 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 904 aa  270  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 924 aa  269  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 904 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 907 aa  268  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 938 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 901 aa  259  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 946 aa  258  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 		 974 aa  257  9e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 873 aa  254  6e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 873 aa  253  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 966 aa  253  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 853 aa  252  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 841 aa  252  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 957 aa  251  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 843 aa  251  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  27.53 
 
 		 839 aa  251  5e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 944 aa  250  8e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  27.45 
 
 		 853 aa  250  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 951 aa  249  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 853 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 838 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 853 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 944 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 853 aa  245  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 855 aa  243  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 855 aa  243  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 952 aa  241  6.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 842 aa  241  6.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 935 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  28.09 
 
 		 914 aa  236  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 951 aa  235  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 947 aa  232  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 975 aa  229  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 836 aa  229  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 985 aa  224  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  29.7 
 
 		 709 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 912 aa  222  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 1020 aa  218  4e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 869 aa  210  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 964 aa  209  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 894 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  26.21 
 
 		 929 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 875 aa  202  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 1015 aa  202  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 967 aa  198  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 982 aa  198  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 1007 aa  197  9e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 940 aa  196  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 1007 aa  196  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  26.47 
 
 		 961 aa  196  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 939 aa  194  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 910 aa  194  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 1040 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 861 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 966 aa  191  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 861 aa  191  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 861 aa  191  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 855 aa  189  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  26.44 
 
 		 1007 aa  188  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 857 aa  187  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.03 
 
 		 969 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 817 aa  187  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 1007 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 861 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 861 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 861 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 852 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 847 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 871 aa  181  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 969 aa  180  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 879 aa  179  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 1028 aa  176  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 901 aa  176  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 948 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  25.38 
 
 		 827 aa  175  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2379  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 1034 aa  169  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0591037  normal  0.158126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>