More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1988 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1988  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1020 aa  2020    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2243  TonB-dependent receptor  51.22 
 
 		 1000 aa  931    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5189  TonB-dependent receptor  34.64 
 
 		 981 aa  453  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4602  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 875 aa  279  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.683128  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2531  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 843 aa  254  6e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2859  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 902 aa  254  7e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115194  normal  0.0892472 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 879 aa  232  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 875 aa  229  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  28.22 
 
 		 880 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 874 aa  213  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 869 aa  209  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 869 aa  207  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 901 aa  201  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 904 aa  195  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2047  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 803 aa  194  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3032  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 874 aa  194  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793097  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  26.1 
 
 		 877 aa  194  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 852 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 855 aa  190  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 891 aa  188  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  27.99 
 
 		 884 aa  188  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 883 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 883 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 873 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 933 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 883 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 910 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 974 aa  183  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 944 aa  181  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 873 aa  181  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  25.96 
 
 		 827 aa  180  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 894 aa  178  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 861 aa  177  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 861 aa  177  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 861 aa  177  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 982 aa  176  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3922  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 948 aa  175  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.719329  normal  0.0833572 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 849 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 884 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 952 aa  175  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 897 aa  174  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 847 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 991 aa  174  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 1055 aa  172  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 861 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 904 aa  172  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 861 aa  172  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 861 aa  171  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 937 aa  171  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 904 aa  171  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 985 aa  170  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 882 aa  170  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 904 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 956 aa  169  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 901 aa  169  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 950 aa  168  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  30.03 
 
 		 914 aa  167  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 882 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 975 aa  165  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 901 aa  164  6e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 904 aa  164  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 953 aa  163  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 944 aa  162  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 857 aa  162  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2600  TonB-dependent receptor  36.42 
 
 		 856 aa  162  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2660  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 979 aa  162  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.436942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 935 aa  161  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 935 aa  161  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 935 aa  161  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 886 aa  160  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 935 aa  160  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  24.43 
 
 		 936 aa  160  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 924 aa  159  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 890 aa  160  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 920 aa  159  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 886 aa  159  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 1088 aa  159  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 930 aa  157  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 855 aa  157  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 855 aa  157  8e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 930 aa  157  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 930 aa  157  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 981 aa  155  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3124  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 973 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 890 aa  154  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 838 aa  152  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0703  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 954 aa  152  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917927 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  26.36 
 
 		 709 aa  152  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 922 aa  152  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 890 aa  151  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 896 aa  152  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 912 aa  151  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 909 aa  151  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 957 aa  151  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 969 aa  150  9e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 939 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  24.75 
 
 		 853 aa  149  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 946 aa  148  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1939  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 854 aa  148  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 909 aa  147  9e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>