More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2600 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2531  TonB-dependent receptor  44.22 
 
 		 843 aa  638    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2600  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 856 aa  1727    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2047  TonB-dependent receptor  32.24 
 
 		 803 aa  340  5e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5189  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 981 aa  183  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2243  TonB-dependent receptor  36.54 
 
 		 1000 aa  158  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1988  TonB-dependent receptor  37.02 
 
 		 1020 aa  156  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2859  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 902 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115194  normal  0.0892472 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 873 aa  139  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  38 
 
 		 891 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4602  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 875 aa  131  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.683128  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  25 
 
 		 883 aa  129  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  38.01 
 
 		 872 aa  124  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  39.22 
 
 		 908 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  38.71 
 
 		 875 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  42.03 
 
 		 884 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 935 aa  117  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  41.26 
 
 		 883 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  41.26 
 
 		 883 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  41.26 
 
 		 883 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3124  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 973 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  39.37 
 
 		 924 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  34.98 
 
 		 939 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  39.37 
 
 		 924 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  25.43 
 
 		 884 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  39.37 
 
 		 924 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  36.52 
 
 		 956 aa  115  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  36.71 
 
 		 849 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  37.69 
 
 		 866 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  39.32 
 
 		 869 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  36.92 
 
 		 974 aa  112  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  37.2 
 
 		 857 aa  111  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 861 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 861 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  37.02 
 
 		 861 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  44.03 
 
 		 991 aa  110  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  37.02 
 
 		 852 aa  110  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  37.32 
 
 		 861 aa  108  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  37.32 
 
 		 861 aa  108  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  35.03 
 
 		 981 aa  108  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  33.48 
 
 		 914 aa  108  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  36.74 
 
 		 882 aa  108  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  38.42 
 
 		 855 aa  108  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  36.71 
 
 		 907 aa  108  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  39.73 
 
 		 935 aa  107  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  37.02 
 
 		 861 aa  108  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 965 aa  107  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  36.32 
 
 		 869 aa  107  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  38.25 
 
 		 873 aa  107  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 		 867 aa  107  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  38.59 
 
 		 874 aa  107  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  34.31 
 
 		 869 aa  107  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  35.22 
 
 		 901 aa  106  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  35.98 
 
 		 882 aa  107  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  35.98 
 
 		 871 aa  107  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  35.24 
 
 		 910 aa  106  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  38.65 
 
 		 922 aa  106  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  40.22 
 
 		 847 aa  106  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3032  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 874 aa  106  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  36.92 
 
 		 985 aa  106  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 		 933 aa  106  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 937 aa  106  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  36 
 
 		 938 aa  105  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  43.36 
 
 		 800 aa  105  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  37.91 
 
 		 817 aa  105  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 		 867 aa  105  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  36.54 
 
 		 886 aa  104  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  36.54 
 
 		 886 aa  104  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  24.87 
 
 		 656 aa  104  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  36.04 
 
 		 975 aa  104  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  37.36 
 
 		 879 aa  104  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 897 aa  104  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 		 867 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 		 867 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  38.34 
 
 		 892 aa  103  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  34.09 
 
 		 866 aa  102  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  33.78 
 
 		 930 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  33.78 
 
 		 930 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 		 890 aa  102  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  34.01 
 
 		 944 aa  101  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 853 aa  101  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37900  putative TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 846 aa  101  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00691809  normal  0.333573 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  36.82 
 
 		 966 aa  101  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 890 aa  101  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  33.78 
 
 		 930 aa  101  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  34.83 
 
 		 912 aa  101  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  35.78 
 
 		 843 aa  101  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  33.95 
 
 		 896 aa  101  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  36.12 
 
 		 895 aa  101  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  24.23 
 
 		 663 aa  100  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  42.68 
 
 		 928 aa  100  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  37.19 
 
 		 925 aa  100  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  24.23 
 
 		 663 aa  100  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  24.23 
 
 		 663 aa  100  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  34.09 
 
 		 953 aa  100  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  24.23 
 
 		 663 aa  100  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  24.23 
 
 		 663 aa  100  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  38.71 
 
 		 890 aa  100  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 876 aa  100  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  24.19 
 
 		 659 aa  100  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  38.69 
 
 		 941 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>