More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2047 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2047  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 803 aa  1627    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5189  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 981 aa  360  6e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2600  TonB-dependent receptor  32.24 
 
 		 856 aa  359  9.999999999999999e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2531  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 843 aa  324  4e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1988  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 1020 aa  198  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2243  TonB-dependent receptor  31.81 
 
 		 1000 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4602  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 875 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.683128  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2859  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 902 aa  175  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115194  normal  0.0892472 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 904 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 904 aa  156  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  37.39 
 
 		 874 aa  137  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  35.79 
 
 		 861 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  35.79 
 
 		 861 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  35.79 
 
 		 861 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  36.49 
 
 		 861 aa  134  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  36.14 
 
 		 861 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  38.21 
 
 		 861 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  37.4 
 
 		 852 aa  132  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  36.07 
 
 		 869 aa  132  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  37.64 
 
 		 855 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  37.34 
 
 		 857 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  35.77 
 
 		 875 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  34.9 
 
 		 914 aa  127  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  36.99 
 
 		 847 aa  127  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  38.1 
 
 		 897 aa  127  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  36.01 
 
 		 849 aa  126  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  36.57 
 
 		 873 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  34.41 
 
 		 922 aa  125  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  36 
 
 		 869 aa  125  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  34.2 
 
 		 928 aa  124  7e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  34.5 
 
 		 950 aa  124  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  37.86 
 
 		 927 aa  123  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  36.07 
 
 		 873 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  35.96 
 
 		 912 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  38.12 
 
 		 907 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 952 aa  122  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  35.43 
 
 		 975 aa  121  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 835 aa  121  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 871 aa  120  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  34.96 
 
 		 925 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  36.91 
 
 		 834 aa  120  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 879 aa  120  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2379  TonB-dependent receptor  33.88 
 
 		 1034 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0591037  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  36.02 
 
 		 908 aa  120  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 800 aa  119  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 		 944 aa  118  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  35.71 
 
 		 827 aa  117  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  36.84 
 
 		 883 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  36.84 
 
 		 883 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  36.22 
 
 		 884 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  36.24 
 
 		 981 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  36.84 
 
 		 883 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  34.34 
 
 		 1009 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  32.54 
 
 		 866 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  36.95 
 
 		 890 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  36.95 
 
 		 890 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  36.14 
 
 		 974 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  36.95 
 
 		 890 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  34.98 
 
 		 937 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  35.59 
 
 		 899 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  36.63 
 
 		 866 aa  115  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 891 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  36.08 
 
 		 910 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03701  TonB-dependent outer membrane receptor  32.89 
 
 		 311 aa  115  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 872 aa  114  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  34.45 
 
 		 836 aa  114  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 981 aa  114  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 		 987 aa  114  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  36 
 
 		 933 aa  114  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 795 aa  114  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  33.88 
 
 		 907 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  25.21 
 
 		 795 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 904 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  36.49 
 
 		 901 aa  112  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 904 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  36.05 
 
 		 991 aa  112  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  33.17 
 
 		 867 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  36.53 
 
 		 944 aa  112  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 901 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3289  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 924 aa  111  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  33.08 
 
 		 944 aa  111  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  37 
 
 		 966 aa  111  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 803 aa  111  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 842 aa  111  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  33.67 
 
 		 867 aa  111  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  36.69 
 
 		 867 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  23.56 
 
 		 800 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  36.63 
 
 		 867 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 922 aa  110  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 939 aa  110  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  33.77 
 
 		 895 aa  109  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1769  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 985 aa  108  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  23.8 
 
 		 813 aa  108  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 883 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 804 aa  108  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 841 aa  108  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 843 aa  108  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3032  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 874 aa  108  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1120  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 942 aa  108  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264761 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 838 aa  107  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>