More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2276 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  49.48 
 
 		 852 aa  825    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 873 aa  1776    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  40.55 
 
 		 879 aa  556  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  34.34 
 
 		 816 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  33.5 
 
 		 804 aa  362  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  32.56 
 
 		 818 aa  362  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 		 885 aa  359  9.999999999999999e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  33.54 
 
 		 847 aa  357  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  31.72 
 
 		 821 aa  352  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 842 aa  352  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  32.53 
 
 		 813 aa  351  3e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 815 aa  346  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 811 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 835 aa  330  7e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 843 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  29.47 
 
 		 840 aa  326  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  31.07 
 
 		 784 aa  324  4e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 793 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  30.73 
 
 		 793 aa  313  5.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  28.41 
 
 		 961 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 853 aa  307  5.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 795 aa  306  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  29.78 
 
 		 884 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 883 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.26 
 
 		 800 aa  304  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 788 aa  302  2e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  30.75 
 
 		 788 aa  301  3e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 842 aa  301  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 933 aa  293  7e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 803 aa  292  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 811 aa  291  4e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  31.02 
 
 		 795 aa  287  7e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 800 aa  286  9e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 858 aa  284  6.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.74 
 
 		 811 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 833 aa  271  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 815 aa  270  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.57 
 
 		 832 aa  260  8e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 797 aa  259  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 797 aa  258  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 924 aa  257  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 812 aa  257  9e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 849 aa  256  9e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 812 aa  256  9e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 797 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 871 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 812 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 850 aa  255  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 803 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 817 aa  251  6e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 797 aa  249  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 795 aa  248  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  26.69 
 
 		 797 aa  239  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 817 aa  236  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 800 aa  233  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 987 aa  226  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 918 aa  223  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  25.58 
 
 		 823 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 847 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 868 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  26.85 
 
 		 870 aa  214  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 874 aa  213  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 872 aa  211  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.14 
 
 		 799 aa  210  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  26.27 
 
 		 848 aa  209  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 887 aa  206  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 924 aa  205  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 948 aa  201  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 853 aa  192  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  24.94 
 
 		 864 aa  185  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 947 aa  174  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  23.71 
 
 		 948 aa  139  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  27.38 
 
 		 867 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 858 aa  127  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 851 aa  126  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 857 aa  124  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 861 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 869 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 867 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 		 877 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  36.89 
 
 		 1015 aa  122  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 867 aa  122  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 870 aa  119  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  25.83 
 
 		 856 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  23.73 
 
 		 853 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  23.73 
 
 		 853 aa  110  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  23.73 
 
 		 853 aa  110  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  23.41 
 
 		 853 aa  103  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  23.29 
 
 		 709 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 838 aa  99.8  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  33.83 
 
 		 839 aa  98.6  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  38.96 
 
 		 855 aa  95.9  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  38.96 
 
 		 855 aa  95.9  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  38.31 
 
 		 853 aa  94.4  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  35.15 
 
 		 873 aa  93.6  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  38.29 
 
 		 929 aa  94  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  35.15 
 
 		 873 aa  93.6  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  40.43 
 
 		 966 aa  92.4  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  35 
 
 		 869 aa  92  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  40.58 
 
 		 944 aa  92  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>