More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2318 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 879 aa  1783    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  40.39 
 
 		 873 aa  577  1.0000000000000001e-163  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  40.62 
 
 		 852 aa  570  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  32.09 
 
 		 818 aa  324  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 		 811 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  31.11 
 
 		 847 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 835 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 804 aa  303  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  31.29 
 
 		 821 aa  300  5e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.06 
 
 		 800 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  30.85 
 
 		 784 aa  297  6e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 815 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 800 aa  293  7e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  28.67 
 
 		 885 aa  290  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 815 aa  289  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  30.42 
 
 		 795 aa  287  8e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  28.61 
 
 		 842 aa  286  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 816 aa  282  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 811 aa  282  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 793 aa  278  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 883 aa  278  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  29.86 
 
 		 788 aa  278  3e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  29.19 
 
 		 793 aa  278  5e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 813 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.75 
 
 		 811 aa  276  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 795 aa  276  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 788 aa  274  5.000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 843 aa  268  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 858 aa  254  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.96 
 
 		 799 aa  254  4.0000000000000004e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 853 aa  254  7e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 817 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  27.68 
 
 		 961 aa  252  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 797 aa  249  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 797 aa  248  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  27.61 
 
 		 840 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 803 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 803 aa  244  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 797 aa  244  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 797 aa  244  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  28.16 
 
 		 823 aa  243  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  28.09 
 
 		 884 aa  243  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 795 aa  242  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 812 aa  241  4e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 812 aa  241  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 842 aa  240  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.32 
 
 		 832 aa  239  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 849 aa  238  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 812 aa  238  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 871 aa  237  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 933 aa  236  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 800 aa  234  7.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 924 aa  229  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  28 
 
 		 874 aa  226  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  27.4 
 
 		 797 aa  219  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 924 aa  217  7e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 887 aa  215  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 868 aa  213  9e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  26.93 
 
 		 918 aa  211  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 833 aa  210  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 850 aa  206  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 987 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 847 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  24.42 
 
 		 856 aa  196  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  26.17 
 
 		 848 aa  196  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 872 aa  191  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 947 aa  187  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 851 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 869 aa  178  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 817 aa  169  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  24.41 
 
 		 864 aa  166  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  27.2 
 
 		 1015 aa  164  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 948 aa  160  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  25.12 
 
 		 870 aa  158  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 853 aa  144  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  28.57 
 
 		 867 aa  141  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 858 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  24.26 
 
 		 948 aa  125  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 870 aa  125  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 867 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 861 aa  121  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 857 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 867 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  24.56 
 
 		 877 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  38.71 
 
 		 951 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  34.76 
 
 		 966 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1988  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 1020 aa  76.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  34.39 
 
 		 901 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  38.71 
 
 		 944 aa  72  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 883 aa  72  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  37.4 
 
 		 869 aa  71.6  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  33.16 
 
 		 957 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0703  TonB-dependent receptor  37.24 
 
 		 954 aa  71.2  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917927 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  34.27 
 
 		 892 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  33.33 
 
 		 877 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 904 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2243  TonB-dependent receptor  42.11 
 
 		 1000 aa  70.5  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  34.78 
 
 		 938 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 883 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 883 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>