More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3801 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 800 aa  1614    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  39.8 
 
 		 823 aa  508  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  39.68 
 
 		 800 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  35.78 
 
 		 856 aa  494  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  40.25 
 
 		 800 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  37.76 
 
 		 867 aa  483  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  36.28 
 
 		 877 aa  464  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  34.63 
 
 		 1015 aa  459  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  39.95 
 
 		 784 aa  455  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 868 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 857 aa  456  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  34.66 
 
 		 872 aa  454  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  36.82 
 
 		 864 aa  448  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 		 869 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  34.26 
 
 		 851 aa  443  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 867 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  38.97 
 
 		 795 aa  440  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  33.84 
 
 		 861 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  33.95 
 
 		 858 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 870 aa  436  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  36.84 
 
 		 788 aa  434  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  33.6 
 
 		 867 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  36.71 
 
 		 788 aa  431  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  36.04 
 
 		 795 aa  401  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  35.79 
 
 		 799 aa  394  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 793 aa  390  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  34.14 
 
 		 843 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  34.58 
 
 		 817 aa  386  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  35.07 
 
 		 793 aa  385  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  35.35 
 
 		 883 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  34.92 
 
 		 811 aa  375  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  34.98 
 
 		 811 aa  369  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  35.08 
 
 		 803 aa  369  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  33.37 
 
 		 840 aa  369  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  33.03 
 
 		 847 aa  368  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  34.06 
 
 		 884 aa  364  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  35.32 
 
 		 803 aa  363  7.0000000000000005e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  34.59 
 
 		 795 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  33.37 
 
 		 818 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  35.55 
 
 		 811 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  34 
 
 		 804 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  34.56 
 
 		 812 aa  357  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 817 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  33.74 
 
 		 797 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  34.36 
 
 		 812 aa  353  5e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  34.43 
 
 		 812 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 797 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  34.69 
 
 		 821 aa  352  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  33.53 
 
 		 815 aa  352  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  34.12 
 
 		 848 aa  351  2e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  33.5 
 
 		 797 aa  350  5e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  33.25 
 
 		 797 aa  349  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  34.61 
 
 		 815 aa  347  7e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 933 aa  337  5e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 853 aa  337  7e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  32.67 
 
 		 847 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  31.29 
 
 		 961 aa  335  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  32.24 
 
 		 918 aa  330  4e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 835 aa  329  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  33.74 
 
 		 871 aa  328  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 924 aa  324  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  33.99 
 
 		 842 aa  323  6e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 874 aa  323  7e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  32.31 
 
 		 797 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 948 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 947 aa  313  6.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 853 aa  313  9e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  32.6 
 
 		 850 aa  312  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  33.2 
 
 		 816 aa  312  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 987 aa  304  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 887 aa  303  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.37 
 
 		 832 aa  299  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 885 aa  288  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 842 aa  283  6.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  30.13 
 
 		 870 aa  281  4e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 		 833 aa  280  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  30.24 
 
 		 813 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 924 aa  266  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 849 aa  261  4e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 858 aa  261  5.0000000000000005e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 852 aa  247  6e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  27.74 
 
 		 873 aa  244  5e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 879 aa  241  4e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  29.84 
 
 		 948 aa  210  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 867 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 867 aa  161  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 867 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 867 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 904 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 904 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  26.72 
 
 		 834 aa  142  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 874 aa  136  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 897 aa  126  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 866 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 893 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  39.91 
 
 		 907 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  35.23 
 
 		 944 aa  111  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  37.82 
 
 		 910 aa  110  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  32.96 
 
 		 929 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  36.87 
 
 		 948 aa  108  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>