More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2466 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  65.17 
 
 		 874 aa  1170    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  50 
 
 		 924 aa  756    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  40.85 
 
 		 947 aa  654    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 887 aa  1790    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  38.37 
 
 		 924 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  35.45 
 
 		 933 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  36.77 
 
 		 843 aa  450  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  35.77 
 
 		 918 aa  449  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  35.75 
 
 		 853 aa  437  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  35.07 
 
 		 853 aa  420  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  35.88 
 
 		 850 aa  415  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  33.12 
 
 		 948 aa  415  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  34.67 
 
 		 812 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 847 aa  403  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  34.79 
 
 		 812 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  35.3 
 
 		 870 aa  401  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 		 812 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  34.7 
 
 		 803 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 817 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  34.26 
 
 		 795 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  33.45 
 
 		 848 aa  398  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  34.24 
 
 		 797 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  34.36 
 
 		 797 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  34.24 
 
 		 797 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  34.76 
 
 		 797 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 817 aa  388  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  34.25 
 
 		 871 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.42 
 
 		 811 aa  383  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 		 797 aa  382  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  33.74 
 
 		 803 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.22 
 
 		 800 aa  365  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 793 aa  365  2e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 811 aa  363  6e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 795 aa  363  8e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  31.65 
 
 		 793 aa  363  8e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  32.1 
 
 		 784 aa  362  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 800 aa  354  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 883 aa  350  7e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  31.46 
 
 		 788 aa  347  5e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 788 aa  346  1e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  30.68 
 
 		 1015 aa  341  2.9999999999999998e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.44 
 
 		 799 aa  336  9e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 		 811 aa  336  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  33.25 
 
 		 842 aa  333  8e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  30.58 
 
 		 864 aa  331  3e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  29.83 
 
 		 884 aa  331  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  31.38 
 
 		 823 aa  330  6e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  31.55 
 
 		 795 aa  330  6e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 		 835 aa  325  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  29.34 
 
 		 840 aa  323  8e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  30.05 
 
 		 867 aa  323  9.000000000000001e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 868 aa  318  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  31.1 
 
 		 821 aa  318  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  31.98 
 
 		 815 aa  318  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  29.31 
 
 		 856 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  35.49 
 
 		 948 aa  315  2.9999999999999996e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 804 aa  311  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  30.22 
 
 		 847 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  30.05 
 
 		 961 aa  303  9e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 818 aa  293  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 800 aa  290  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 867 aa  289  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 851 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 861 aa  281  5e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 858 aa  281  5e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  33 
 
 		 987 aa  278  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 877 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 816 aa  275  4.0000000000000004e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 869 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 872 aa  271  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 857 aa  268  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 849 aa  267  5.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.15 
 
 		 832 aa  265  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 833 aa  262  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 885 aa  256  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 842 aa  253  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 815 aa  237  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 813 aa  236  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 858 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  24.94 
 
 		 873 aa  206  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 852 aa  200  9e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 879 aa  194  8e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 867 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 870 aa  171  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 901 aa  137  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 817 aa  120  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  26.71 
 
 		 839 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 841 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 836 aa  109  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  41.18 
 
 		 843 aa  103  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 1114 aa  102  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  33.73 
 
 		 1035 aa  103  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 853 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 853 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 853 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  35.32 
 
 		 1020 aa  102  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  37.31 
 
 		 842 aa  100  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  41.77 
 
 		 857 aa  100  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  35.04 
 
 		 838 aa  100  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  33.06 
 
 		 1095 aa  100  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>