More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1277 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  58.9 
 
 		 784 aa  867    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  50.7 
 
 		 795 aa  738    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 793 aa  1615    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  98.49 
 
 		 793 aa  1592    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  48.08 
 
 		 788 aa  719    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  47.71 
 
 		 788 aa  715    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  66.23 
 
 		 795 aa  1045    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  42.46 
 
 		 800 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  42.96 
 
 		 800 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  42.28 
 
 		 799 aa  550  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  39.95 
 
 		 803 aa  489  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  39.01 
 
 		 795 aa  484  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  36.66 
 
 		 853 aa  482  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  37.67 
 
 		 811 aa  481  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  36.72 
 
 		 843 aa  478  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  36.08 
 
 		 811 aa  467  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  37.7 
 
 		 803 aa  459  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  35.75 
 
 		 933 aa  456  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  37.39 
 
 		 797 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  36.75 
 
 		 817 aa  444  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  37.76 
 
 		 812 aa  445  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  37.86 
 
 		 812 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  37.52 
 
 		 797 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  37.76 
 
 		 812 aa  446  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  37.52 
 
 		 797 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  36.66 
 
 		 797 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  37.04 
 
 		 815 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  35.18 
 
 		 840 aa  429  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  38.14 
 
 		 797 aa  428  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  36.27 
 
 		 811 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  33.37 
 
 		 948 aa  412  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  35.41 
 
 		 835 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  35.88 
 
 		 884 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  34.15 
 
 		 961 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  35.42 
 
 		 832 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  32.91 
 
 		 853 aa  398  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  35.97 
 
 		 815 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  36.43 
 
 		 883 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  36.4 
 
 		 847 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  34.92 
 
 		 918 aa  395  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  34.27 
 
 		 870 aa  392  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  34.89 
 
 		 823 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  34.79 
 
 		 821 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 847 aa  385  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  35.91 
 
 		 842 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  34.92 
 
 		 800 aa  379  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  33.54 
 
 		 818 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  33.37 
 
 		 924 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 804 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 		 817 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  33.95 
 
 		 885 aa  369  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 887 aa  365  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  29.21 
 
 		 856 aa  362  1e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  32.96 
 
 		 842 aa  362  2e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 874 aa  361  3e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 868 aa  361  3e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  32.69 
 
 		 848 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  32.59 
 
 		 833 aa  358  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 857 aa  357  5e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 861 aa  357  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 858 aa  354  4e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  30.96 
 
 		 867 aa  352  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 851 aa  350  8e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 867 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 871 aa  346  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 858 aa  346  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 816 aa  343  5.999999999999999e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  29.98 
 
 		 877 aa  343  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 869 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  31.41 
 
 		 813 aa  337  3.9999999999999995e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 872 aa  333  9e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 867 aa  329  9e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 		 850 aa  323  8e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 870 aa  321  3e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  30.82 
 
 		 873 aa  315  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  29.18 
 
 		 864 aa  315  2.9999999999999996e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 849 aa  309  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 924 aa  303  6.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 947 aa  291  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 852 aa  291  3e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 879 aa  258  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  31.15 
 
 		 1015 aa  236  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  28.97 
 
 		 948 aa  206  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 987 aa  204  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  25.72 
 
 		 834 aa  154  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 904 aa  154  7e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 904 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 869 aa  151  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 904 aa  150  8e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 904 aa  149  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 869 aa  146  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 838 aa  142  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  26.66 
 
 		 709 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 873 aa  140  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 873 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  25.04 
 
 		 853 aa  138  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  23.97 
 
 		 936 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 817 aa  135  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 953 aa  131  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 853 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>