More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2320 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  41.03 
 
 		 874 aa  659    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  40.85 
 
 		 887 aa  654    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 947 aa  1929    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  39.5 
 
 		 924 aa  553  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  36.75 
 
 		 924 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  36.35 
 
 		 933 aa  502  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  33.51 
 
 		 918 aa  422  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  35.9 
 
 		 843 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  34.28 
 
 		 847 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 987 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  34.23 
 
 		 850 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  34.39 
 
 		 848 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  33.26 
 
 		 853 aa  377  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  34.6 
 
 		 817 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.06 
 
 		 800 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  33.45 
 
 		 870 aa  372  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 		 948 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  33.74 
 
 		 800 aa  365  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  32.51 
 
 		 795 aa  363  6e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  33.93 
 
 		 797 aa  362  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 812 aa  361  4e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  34.01 
 
 		 797 aa  360  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  33.41 
 
 		 803 aa  359  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 853 aa  358  2.9999999999999997e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 812 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 812 aa  357  5e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  33.9 
 
 		 797 aa  357  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  33.57 
 
 		 797 aa  355  2e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  33.96 
 
 		 803 aa  350  8e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 		 811 aa  341  4e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  32.76 
 
 		 784 aa  332  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.9 
 
 		 811 aa  333  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 817 aa  328  3e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 811 aa  328  4.0000000000000003e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  32.05 
 
 		 788 aa  325  2e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  32.05 
 
 		 788 aa  325  3e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 795 aa  323  8e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  32.27 
 
 		 797 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  30.59 
 
 		 961 aa  321  5e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.75 
 
 		 799 aa  318  4e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 871 aa  317  5e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  32.55 
 
 		 821 aa  317  7e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 815 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  33.25 
 
 		 795 aa  313  6.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  30.49 
 
 		 840 aa  307  6e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  29.6 
 
 		 867 aa  302  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 800 aa  301  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  31.08 
 
 		 823 aa  301  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 804 aa  300  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 883 aa  292  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 793 aa  291  3e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  29.51 
 
 		 793 aa  291  4e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  30.01 
 
 		 884 aa  290  8e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  27.42 
 
 		 856 aa  290  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 835 aa  289  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 869 aa  289  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.91 
 
 		 832 aa  287  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  28.43 
 
 		 1015 aa  285  3.0000000000000004e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 857 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 867 aa  284  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 867 aa  283  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 851 aa  283  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 858 aa  280  8e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 842 aa  279  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 861 aa  279  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 870 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 872 aa  275  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 868 aa  273  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  33.55 
 
 		 948 aa  272  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  28.37 
 
 		 864 aa  263  8e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 816 aa  263  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  30.06 
 
 		 818 aa  262  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  30.42 
 
 		 847 aa  261  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 833 aa  260  8e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 813 aa  254  5.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 849 aa  249  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 858 aa  246  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 885 aa  234  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 815 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 842 aa  231  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 879 aa  186  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 852 aa  178  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 861 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 861 aa  174  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 861 aa  174  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  25.15 
 
 		 873 aa  175  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 861 aa  172  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 861 aa  170  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 861 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 857 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 877 aa  166  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 849 aa  154  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 855 aa  149  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 874 aa  148  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 836 aa  147  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 869 aa  140  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 817 aa  136  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 842 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 867 aa  131  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 867 aa  129  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>