More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1586 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  50.26 
 
 		 813 aa  754    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  48.66 
 
 		 804 aa  756    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  47.66 
 
 		 847 aa  748    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  45.62 
 
 		 818 aa  699    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  43.88 
 
 		 884 aa  652    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  44.73 
 
 		 883 aa  658    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 816 aa  1671    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  43.04 
 
 		 842 aa  627  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  42.21 
 
 		 885 aa  621  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  37.37 
 
 		 821 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  36.11 
 
 		 815 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  34.64 
 
 		 811 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  33.41 
 
 		 873 aa  388  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  35.29 
 
 		 784 aa  385  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.75 
 
 		 800 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  34.42 
 
 		 800 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 		 803 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 		 842 aa  362  2e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.8 
 
 		 832 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 858 aa  357  5.999999999999999e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  32.87 
 
 		 852 aa  357  5.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 793 aa  355  2e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  33.21 
 
 		 788 aa  354  2.9999999999999997e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  33.08 
 
 		 788 aa  353  5e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  32.08 
 
 		 793 aa  350  6e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 811 aa  349  9e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 843 aa  346  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 933 aa  346  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  32.82 
 
 		 795 aa  343  5e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  33.16 
 
 		 795 aa  342  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 835 aa  339  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 812 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 812 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 812 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 797 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 797 aa  337  5e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 		 817 aa  335  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.79 
 
 		 799 aa  335  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 803 aa  334  4e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 797 aa  333  1e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 797 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  32.83 
 
 		 795 aa  329  1.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  31.25 
 
 		 840 aa  326  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  33.2 
 
 		 800 aa  322  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  29.95 
 
 		 833 aa  322  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.89 
 
 		 811 aa  319  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 849 aa  316  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 853 aa  314  3.9999999999999997e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  30.13 
 
 		 961 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 924 aa  302  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 918 aa  302  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 924 aa  302  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 815 aa  298  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  29.99 
 
 		 797 aa  294  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 871 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 879 aa  288  2.9999999999999996e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 850 aa  288  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 887 aa  287  5e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 868 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 847 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  31.4 
 
 		 848 aa  281  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 947 aa  280  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  29.18 
 
 		 823 aa  277  6e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 872 aa  272  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  29.31 
 
 		 870 aa  270  8.999999999999999e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 851 aa  267  7e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 874 aa  265  2e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 853 aa  261  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 948 aa  261  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 817 aa  253  9.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  29.16 
 
 		 864 aa  247  8e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 858 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 861 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 987 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  26.88 
 
 		 948 aa  180  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  27.26 
 
 		 853 aa  147  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  37.11 
 
 		 857 aa  147  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  26.98 
 
 		 839 aa  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 838 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  30.92 
 
 		 1015 aa  142  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  34.32 
 
 		 870 aa  140  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  27.4 
 
 		 856 aa  140  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  35.94 
 
 		 869 aa  140  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  33.96 
 
 		 877 aa  140  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  35.34 
 
 		 867 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  35.34 
 
 		 867 aa  137  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  38.5 
 
 		 867 aa  137  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 817 aa  132  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 873 aa  132  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2600  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 856 aa  121  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2531  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 843 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5189  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 981 aa  118  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  36.43 
 
 		 852 aa  111  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  37.21 
 
 		 861 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  37.21 
 
 		 861 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  36.82 
 
 		 861 aa  109  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  40.41 
 
 		 849 aa  108  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  36.05 
 
 		 861 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  36.05 
 
 		 861 aa  108  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  36.05 
 
 		 861 aa  108  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>