More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2260 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 852 aa  1749    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  49.37 
 
 		 873 aa  823    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  40.12 
 
 		 879 aa  550  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  34.55 
 
 		 818 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 		 804 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  34.19 
 
 		 847 aa  366  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  32.87 
 
 		 816 aa  340  7e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 835 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 811 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  31.51 
 
 		 821 aa  335  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 815 aa  324  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 883 aa  321  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 842 aa  318  4e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  30.42 
 
 		 885 aa  315  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.76 
 
 		 800 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  30.07 
 
 		 813 aa  305  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 800 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  30.47 
 
 		 788 aa  303  9e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 788 aa  300  1e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  31.54 
 
 		 784 aa  296  1e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 795 aa  293  8e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 871 aa  291  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 793 aa  291  4e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  30.08 
 
 		 793 aa  290  7e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  29.65 
 
 		 884 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 843 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  29.2 
 
 		 795 aa  281  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 842 aa  274  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.51 
 
 		 811 aa  269  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  30.11 
 
 		 840 aa  270  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 815 aa  267  5e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 933 aa  262  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.43 
 
 		 799 aa  259  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 811 aa  259  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 853 aa  259  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 797 aa  258  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 797 aa  258  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 797 aa  257  5e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 797 aa  257  8e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 812 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 803 aa  252  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 812 aa  251  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  28.64 
 
 		 961 aa  251  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 812 aa  250  6e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 817 aa  250  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 849 aa  249  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.83 
 
 		 832 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  29.06 
 
 		 823 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 850 aa  243  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 795 aa  239  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  27.93 
 
 		 870 aa  239  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 800 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 858 aa  235  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 817 aa  221  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 833 aa  219  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 803 aa  219  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 868 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 924 aa  213  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 857 aa  212  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  26.05 
 
 		 918 aa  209  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 948 aa  206  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  26.54 
 
 		 797 aa  205  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  25.72 
 
 		 856 aa  203  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  27.06 
 
 		 848 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 847 aa  202  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 853 aa  201  6e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 887 aa  200  9e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 851 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 872 aa  198  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  25.85 
 
 		 867 aa  197  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 874 aa  195  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 924 aa  192  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 987 aa  184  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  24.16 
 
 		 1015 aa  180  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 947 aa  178  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  25.68 
 
 		 864 aa  178  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 861 aa  138  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 858 aa  137  8e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 867 aa  134  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 867 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 869 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  26.69 
 
 		 877 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  25.04 
 
 		 948 aa  117  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 870 aa  115  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 836 aa  96.3  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  36.41 
 
 		 839 aa  89.7  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  25.78 
 
 		 709 aa  88.6  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  37.76 
 
 		 884 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  37.76 
 
 		 883 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  37.76 
 
 		 883 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  37.76 
 
 		 883 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  37.64 
 
 		 966 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 		 951 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  33.18 
 
 		 935 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  40.43 
 
 		 853 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  33.18 
 
 		 935 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  33.18 
 
 		 935 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  40.43 
 
 		 969 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 944 aa  82.4  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  34.76 
 
 		 842 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>