More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2896 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  52.36 
 
 		 861 aa  851    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  50.3 
 
 		 870 aa  785    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  51.4 
 
 		 1015 aa  810    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  53.13 
 
 		 857 aa  865    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  50.29 
 
 		 869 aa  816    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  53.88 
 
 		 877 aa  879    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  52.46 
 
 		 867 aa  857    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  52.63 
 
 		 851 aa  840    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  52.46 
 
 		 867 aa  857    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  52.61 
 
 		 858 aa  852    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  100 
 
 		 867 aa  1772    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  57.5 
 
 		 856 aa  939    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  40.74 
 
 		 823 aa  565  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  38.44 
 
 		 864 aa  522  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  35.73 
 
 		 868 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  37.59 
 
 		 800 aa  463  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  33.44 
 
 		 872 aa  445  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  34.31 
 
 		 843 aa  423  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  35.21 
 
 		 817 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.76 
 
 		 800 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  34.76 
 
 		 797 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  34.91 
 
 		 797 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  34.4 
 
 		 803 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  34.53 
 
 		 797 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  35.22 
 
 		 812 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  34.53 
 
 		 797 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  35.1 
 
 		 812 aa  412  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  35.1 
 
 		 812 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 800 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  34 
 
 		 847 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  33.85 
 
 		 853 aa  392  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  33.22 
 
 		 840 aa  381  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  34.24 
 
 		 848 aa  381  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  32.7 
 
 		 817 aa  379  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 		 853 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 948 aa  375  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  33.57 
 
 		 784 aa  371  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  34.16 
 
 		 795 aa  369  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  33.1 
 
 		 797 aa  369  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 795 aa  363  9e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  30.43 
 
 		 870 aa  362  2e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  31.08 
 
 		 793 aa  360  7e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 793 aa  359  9.999999999999999e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  30.95 
 
 		 788 aa  357  6.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  32.73 
 
 		 811 aa  355  2.9999999999999997e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 795 aa  354  4e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 874 aa  354  4e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 788 aa  353  7e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  31.67 
 
 		 961 aa  351  3e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 		 803 aa  349  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  31.12 
 
 		 918 aa  345  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.49 
 
 		 811 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.88 
 
 		 799 aa  335  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 835 aa  331  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 842 aa  327  8.000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  31.49 
 
 		 821 aa  324  5e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 887 aa  323  7e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 		 811 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.88 
 
 		 832 aa  320  6e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 815 aa  320  7e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 933 aa  315  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 804 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  30 
 
 		 883 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 924 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 947 aa  303  8.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  29.62 
 
 		 884 aa  303  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 815 aa  303  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  30.48 
 
 		 818 aa  283  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  30.6 
 
 		 847 aa  279  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 924 aa  278  5e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 987 aa  265  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 850 aa  264  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  27.54 
 
 		 833 aa  260  6e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 842 aa  253  8.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 813 aa  251  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 885 aa  250  9e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 849 aa  242  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  30.14 
 
 		 948 aa  202  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 852 aa  197  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 873 aa  191  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 871 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  40.96 
 
 		 858 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 843 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 841 aa  147  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 836 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 867 aa  137  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  38.5 
 
 		 816 aa  137  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 867 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 867 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 867 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 842 aa  131  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  24.3 
 
 		 839 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 855 aa  128  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 853 aa  126  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  25.52 
 
 		 853 aa  125  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 838 aa  124  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  25.16 
 
 		 853 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  25.16 
 
 		 853 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 853 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 855 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>