More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1061 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  100 
 
 
867 aa  1762    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  52.13 
 
 
877 aa  879    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  96.19 
 
 
861 aa  1684    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  77.92 
 
 
870 aa  1328    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  80.28 
 
 
857 aa  1447    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  64.54 
 
 
869 aa  1103    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  97 
 
 
867 aa  1717    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  95.27 
 
 
858 aa  1665    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  43.51 
 
 
1015 aa  672    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  81.31 
 
 
851 aa  1441    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  48.84 
 
 
856 aa  779    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  52.83 
 
 
867 aa  827    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  37.84 
 
 
823 aa  544  1e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  35.66 
 
 
868 aa  521  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  36.57 
 
 
864 aa  521  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  33.23 
 
 
872 aa  420  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 
803 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 
800 aa  416  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  33.15 
 
 
817 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  32.06 
 
 
847 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  32.96 
 
 
853 aa  385  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 
812 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.94 
 
 
800 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 
948 aa  361  4e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 
795 aa  360  7e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  31 
 
 
817 aa  360  8e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  31.4 
 
 
784 aa  354  2.9999999999999997e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  29.75 
 
 
793 aa  345  2.9999999999999997e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  31.38 
 
 
848 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 
811 aa  343  7e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 
853 aa  340  5e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  30.35 
 
 
870 aa  338  2.9999999999999997e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 
793 aa  329  1.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  30.72 
 
 
874 aa  328  2.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 
918 aa  327  5e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  30.06 
 
 
821 aa  323  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 
803 aa  320  6e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 
804 aa  317  6e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 
815 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.8 
 
 
811 aa  313  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 
795 aa  312  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 
871 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 
924 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 
842 aa  302  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  31.62 
 
 
847 aa  296  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  37.23 
 
 
843 aa  295  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 
947 aa  283  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 
858 aa  272  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  28.29 
 
 
833 aa  270  5.9999999999999995e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 
924 aa  265  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 
850 aa  253  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 
797 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 
797 aa  245  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 
797 aa  245  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 
797 aa  243  9e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 
813 aa  239  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  32.09 
 
 
812 aa  238  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  32.09 
 
 
812 aa  238  4e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 
987 aa  232  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  32.48 
 
 
797 aa  229  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  30.99 
 
 
840 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  33.52 
 
 
795 aa  224  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  33.68 
 
 
800 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  30.63 
 
 
788 aa  213  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.26 
 
 
799 aa  210  7e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 
788 aa  208  3e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  31.54 
 
 
884 aa  207  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  31.77 
 
 
883 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  28.93 
 
 
961 aa  205  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  30.5 
 
 
815 aa  202  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 
811 aa  195  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 
835 aa  188  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 
887 aa  186  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  29.68 
 
 
818 aa  179  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  28.01 
 
 
948 aa  175  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  37.5 
 
 
832 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  28.59 
 
 
842 aa  171  5e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 
933 aa  170  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 
885 aa  167  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 
842 aa  152  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 
843 aa  149  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 
849 aa  149  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 
855 aa  144  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 
853 aa  144  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 
853 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 
853 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 
841 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  25.08 
 
 
839 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 
853 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  35.34 
 
 
816 aa  137  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 
855 aa  135  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  25.79 
 
 
853 aa  135  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 
852 aa  134  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 
838 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 
867 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 
867 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 
867 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 
866 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 
867 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 
868 aa  126  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>