More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0668 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 757 aa  1568    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  27.18 
 
 		 639 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  26.85 
 
 		 646 aa  172  3e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 647 aa  156  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 665 aa  141  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.89 
 
 		 653 aa  140  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 613 aa  138  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 649 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 634 aa  135  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1088  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 679 aa  134  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  34.49 
 
 		 848 aa  132  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  25.57 
 
 		 661 aa  132  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 642 aa  130  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  34.92 
 
 		 833 aa  130  9.000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 648 aa  127  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  25.32 
 
 		 668 aa  127  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 657 aa  123  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  33.2 
 
 		 760 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 918 aa  122  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  24.96 
 
 		 634 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 726 aa  116  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5117  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 801 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 		 753 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  30.9 
 
 		 748 aa  114  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 638 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 649 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 924 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 702 aa  112  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 602 aa  112  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  33.2 
 
 		 783 aa  110  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 652 aa  110  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  23.78 
 
 		 676 aa  110  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.92 
 
 		 623 aa  110  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 828 aa  110  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 763 aa  110  9.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 649 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 653 aa  110  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 661 aa  109  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  29.63 
 
 		 750 aa  109  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  23.75 
 
 		 739 aa  107  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  25.72 
 
 		 695 aa  107  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  22.58 
 
 		 699 aa  107  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 778 aa  107  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  24.83 
 
 		 617 aa  105  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  26.11 
 
 		 677 aa  105  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  26.4 
 
 		 698 aa  103  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 736 aa  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 798 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  39.1 
 
 		 681 aa  103  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  41.24 
 
 		 688 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 		 836 aa  103  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 658 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 680 aa  102  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 614 aa  102  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 698 aa  102  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 653 aa  102  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 1128 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  25.89 
 
 		 702 aa  101  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 624 aa  100  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 893 aa  100  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 635 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 648 aa  99.8  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 866 aa  99  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  24.14 
 
 		 623 aa  98.6  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.72 
 
 		 615 aa  98.2  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  23.82 
 
 		 746 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 742 aa  98.2  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  22.76 
 
 		 617 aa  97.4  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 627 aa  97.4  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  23.68 
 
 		 746 aa  97.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  33.61 
 
 		 1075 aa  96.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 987 aa  96.3  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  25.55 
 
 		 696 aa  95.9  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  23.27 
 
 		 634 aa  95.5  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 734 aa  95.9  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  24.16 
 
 		 618 aa  95.1  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  27.42 
 
 		 795 aa  94.7  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 1066 aa  94.4  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7219  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 698 aa  94  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  28.17 
 
 		 861 aa  94  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 670 aa  93.6  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.86 
 
 		 1023 aa  93.2  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7217  TonB-dependent receptor  45.83 
 
 		 707 aa  92.8  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  31.02 
 
 		 747 aa  92.4  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  31.98 
 
 		 988 aa  92.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  32.81 
 
 		 933 aa  91.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  31.08 
 
 		 1127 aa  91.7  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 769 aa  91.3  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 707 aa  90.9  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3886  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 642 aa  91.3  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.322303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  22.02 
 
 		 735 aa  90.5  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  25.98 
 
 		 659 aa  90.9  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 947 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 751 aa  90.1  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  26.55 
 
 		 650 aa  90.1  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 1089 aa  90.5  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  38.69 
 
 		 647 aa  90.1  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 733 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 642 aa  89.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  24.39 
 
 		 724 aa  88.6  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>