More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01534 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  100 
 
 		 647 aa  1324    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  45.11 
 
 		 677 aa  543  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  30.95 
 
 		 661 aa  239  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 1128 aa  146  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  31.42 
 
 		 707 aa  143  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.69 
 
 		 616 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 694 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 688 aa  131  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  24.73 
 
 		 617 aa  126  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7217  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 707 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 653 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.34 
 
 		 1023 aa  118  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  24.26 
 
 		 666 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  24.26 
 
 		 666 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  24.05 
 
 		 666 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  24.26 
 
 		 666 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  24.23 
 
 		 666 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  23.85 
 
 		 628 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  24.4 
 
 		 663 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1088  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 679 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  24.96 
 
 		 668 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  23.59 
 
 		 665 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 635 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  23.48 
 
 		 665 aa  111  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  23.48 
 
 		 665 aa  111  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  24.04 
 
 		 663 aa  108  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  25.33 
 
 		 572 aa  108  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.83 
 
 		 614 aa  107  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.59 
 
 		 614 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.59 
 
 		 614 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.39 
 
 		 614 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  22.76 
 
 		 646 aa  105  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.59 
 
 		 614 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  24.75 
 
 		 634 aa  101  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.78 
 
 		 631 aa  99  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  40.58 
 
 		 613 aa  98.2  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.62 
 
 		 614 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  21.92 
 
 		 602 aa  97.4  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.55 
 
 		 614 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.32 
 
 		 614 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 640 aa  96.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  33.76 
 
 		 656 aa  96.3  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.32 
 
 		 614 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 611 aa  95.1  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 627 aa  95.1  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.1 
 
 		 614 aa  95.1  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  24.45 
 
 		 760 aa  95.1  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.1 
 
 		 614 aa  94.4  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  22.31 
 
 		 652 aa  94  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 612 aa  93.6  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 658 aa  93.6  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  35.03 
 
 		 618 aa  93.2  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  24.96 
 
 		 634 aa  92.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  22.32 
 
 		 652 aa  92.8  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  21.44 
 
 		 659 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  36.36 
 
 		 653 aa  92  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  26.01 
 
 		 750 aa  91.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  23.11 
 
 		 620 aa  91.3  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  21.98 
 
 		 686 aa  91.3  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 669 aa  90.9  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  33.33 
 
 		 663 aa  90.9  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 663 aa  90.9  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  33.33 
 
 		 663 aa  90.9  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 642 aa  90.9  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  33.33 
 
 		 663 aa  90.9  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  33.33 
 
 		 663 aa  90.9  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  33.33 
 
 		 663 aa  90.9  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  25.87 
 
 		 753 aa  90.5  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  38.69 
 
 		 757 aa  89.7  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  34.69 
 
 		 848 aa  89.4  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  24.06 
 
 		 645 aa  89.4  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 697 aa  89  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 624 aa  89.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  36.42 
 
 		 634 aa  89.7  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  34.64 
 
 		 616 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  23.03 
 
 		 611 aa  89.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  21.55 
 
 		 650 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.86 
 
 		 623 aa  88.6  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  21.7 
 
 		 650 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  34.36 
 
 		 661 aa  88.6  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  36.09 
 
 		 737 aa  88.6  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  23.02 
 
 		 676 aa  89  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  21.64 
 
 		 650 aa  88.2  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  30.77 
 
 		 833 aa  87.8  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  21.64 
 
 		 650 aa  87.8  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  32.3 
 
 		 647 aa  87.8  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  40 
 
 		 639 aa  87.8  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 736 aa  87.8  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 		 742 aa  87.8  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  32.82 
 
 		 648 aa  87.4  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  36.88 
 
 		 742 aa  87  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.44 
 
 		 631 aa  86.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  37.82 
 
 		 646 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  23.12 
 
 		 655 aa  86.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  36.26 
 
 		 649 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 		 657 aa  85.9  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2526  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 620 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.995023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.67 
 
 		 615 aa  85.5  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  30.27 
 
 		 633 aa  85.5  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  33.84 
 
 		 937 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>