More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1561 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 681 aa  1398    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  34.06 
 
 		 751 aa  331  3e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  32.95 
 
 		 706 aa  317  5e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 699 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1928  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 676 aa  264  4e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00435524  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 688 aa  150  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.77 
 
 		 653 aa  133  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  40.61 
 
 		 639 aa  127  8.000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  23.97 
 
 		 744 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  23.97 
 
 		 744 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 709 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 651 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  23.68 
 
 		 744 aa  118  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1116  outer membrane receptor FepA  24.25 
 
 		 750 aa  117  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.02 
 
 		 614 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 649 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.86 
 
 		 614 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.86 
 
 		 614 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.86 
 
 		 614 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3743  outer membrane receptor FepA  24.49 
 
 		 766 aa  114  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.325826  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  22.98 
 
 		 661 aa  114  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  23.31 
 
 		 746 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  23.58 
 
 		 668 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.71 
 
 		 614 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.7 
 
 		 613 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.01 
 
 		 631 aa  111  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  23.35 
 
 		 746 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  24.18 
 
 		 655 aa  111  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  23.25 
 
 		 746 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  24.68 
 
 		 628 aa  110  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 736 aa  110  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1485  outer membrane receptor FepA  24.86 
 
 		 777 aa  108  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0839984  normal  0.152216 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 698 aa  107  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 698 aa  107  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 698 aa  107  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  33.94 
 
 		 646 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  23.3 
 
 		 700 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  22.43 
 
 		 697 aa  106  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  22.69 
 
 		 614 aa  105  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  23.59 
 
 		 628 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.69 
 
 		 614 aa  105  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.54 
 
 		 614 aa  104  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.54 
 
 		 614 aa  103  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.13 
 
 		 614 aa  103  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  23.79 
 
 		 623 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  23.22 
 
 		 680 aa  103  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  23.07 
 
 		 698 aa  103  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  42.03 
 
 		 1128 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.19 
 
 		 614 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  22.83 
 
 		 656 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 742 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  38.18 
 
 		 659 aa  102  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 746 aa  102  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  38.18 
 
 		 663 aa  101  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  38.18 
 
 		 663 aa  101  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  38.18 
 
 		 663 aa  101  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  38.18 
 
 		 663 aa  101  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  23.47 
 
 		 662 aa  101  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  38.18 
 
 		 663 aa  101  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 653 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  38.18 
 
 		 663 aa  101  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  35.1 
 
 		 653 aa  101  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  29.35 
 
 		 633 aa  101  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 680 aa  101  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  37.81 
 
 		 652 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  38.42 
 
 		 653 aa  100  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  40.37 
 
 		 653 aa  100  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  40.37 
 
 		 653 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 653 aa  99.8  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  40.25 
 
 		 665 aa  99.8  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  40.37 
 
 		 653 aa  99.8  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  39.33 
 
 		 656 aa  99.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  37.31 
 
 		 653 aa  99  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  37.44 
 
 		 634 aa  98.6  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  36.45 
 
 		 659 aa  97.4  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  39.04 
 
 		 650 aa  97.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  34.88 
 
 		 656 aa  97.4  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  39.04 
 
 		 650 aa  97.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  39.04 
 
 		 650 aa  97.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  39.04 
 
 		 650 aa  97.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  39.04 
 
 		 650 aa  97.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  34.64 
 
 		 694 aa  96.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 647 aa  96.7  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  39.01 
 
 		 613 aa  96.7  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  41.01 
 
 		 641 aa  97.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2289  TonB-dependent receptor plug  24.23 
 
 		 719 aa  96.7  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 641 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  22.38 
 
 		 638 aa  95.1  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  35.78 
 
 		 652 aa  95.1  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  33.94 
 
 		 618 aa  95.1  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  33.69 
 
 		 624 aa  94.7  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  37.91 
 
 		 651 aa  94.4  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 634 aa  94.4  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  35.15 
 
 		 613 aa  94.4  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2213  TonB-dependent receptor plug  22.53 
 
 		 621 aa  93.6  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  34.18 
 
 		 763 aa  93.6  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 648 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  22.97 
 
 		 611 aa  93.6  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 815 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 678 aa  93.6  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>