More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3176 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  91.42 
 
 		 653 aa  1239    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  68.34 
 
 		 665 aa  918    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2631  TonB-dependent receptor domain-containing protein  56.69 
 
 		 646 aa  730    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  67.82 
 
 		 656 aa  900    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  90.66 
 
 		 653 aa  1207    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  57.38 
 
 		 656 aa  763    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  91.42 
 
 		 653 aa  1215    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  90.51 
 
 		 653 aa  1199    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  91.42 
 
 		 653 aa  1221    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  91.58 
 
 		 653 aa  1225    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  61.84 
 
 		 659 aa  799    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  88.36 
 
 		 652 aa  1192    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 653 aa  1333    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  90.96 
 
 		 653 aa  1226    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  27.53 
 
 		 713 aa  206  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4390  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 704 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 688 aa  169  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2309  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  29.58 
 
 		 666 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 704 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 657 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 638 aa  147  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 644 aa  143  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0635  TonB-dependent receptor, plug  24.76 
 
 		 706 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 656 aa  123  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  24.36 
 
 		 664 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 700 aa  110  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 700 aa  109  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 700 aa  109  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 700 aa  108  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 700 aa  107  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 		 776 aa  106  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 700 aa  105  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 700 aa  105  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  23.46 
 
 		 690 aa  104  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  37.7 
 
 		 618 aa  103  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  23.91 
 
 		 728 aa  103  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  24.32 
 
 		 700 aa  101  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  35.1 
 
 		 681 aa  101  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  24.32 
 
 		 700 aa  101  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.51 
 
 		 619 aa  101  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  23.69 
 
 		 617 aa  100  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 648 aa  99.4  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  24.62 
 
 		 712 aa  99  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 720 aa  98.2  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  24.77 
 
 		 815 aa  97.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  25.21 
 
 		 678 aa  97.4  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 715 aa  96.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1786  TonB-dependent heme receptor  21.9 
 
 		 718 aa  95.9  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  22.69 
 
 		 795 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1964  TonB-dependent receptor, plug  30.57 
 
 		 618 aa  96.3  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  25.98 
 
 		 812 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  24.16 
 
 		 703 aa  95.1  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2735  TonB-dependent receptor, plug  29.69 
 
 		 650 aa  95.1  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 706 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  34.34 
 
 		 729 aa  94.4  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  24.55 
 
 		 689 aa  94.4  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 		 789 aa  94  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 701 aa  94  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  23.68 
 
 		 825 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 		 621 aa  93.6  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  25.04 
 
 		 710 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  25.08 
 
 		 821 aa  92.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0909  ferrioxamine B receptor  21.98 
 
 		 716 aa  92.8  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 720 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 720 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  24.14 
 
 		 720 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.55 
 
 		 623 aa  92.8  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  25.32 
 
 		 720 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  36.88 
 
 		 593 aa  92  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  22.44 
 
 		 731 aa  91.7  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1474  TonB-dependent siderophore receptor  24.79 
 
 		 715 aa  91.3  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  31.52 
 
 		 627 aa  90.9  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  23.49 
 
 		 825 aa  90.9  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0118  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 633 aa  90.9  7e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  26.48 
 
 		 628 aa  90.5  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1601  TonB-dependent heme receptor  22.42 
 
 		 702 aa  90.1  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0947  TonB-dependent siderophore receptor  22.51 
 
 		 683 aa  89.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0779656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  41.48 
 
 		 751 aa  90.1  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  22.51 
 
 		 664 aa  90.1  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0273  TonB-dependent receptor  32.98 
 
 		 602 aa  89.7  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0292443  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2389  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 615 aa  89  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000607441  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 634 aa  88.6  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4786  TonB-dependent siderophore receptor  23.04 
 
 		 712 aa  88.6  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.789588  normal  0.608467 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 641 aa  88.2  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 948 aa  88.2  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  23.9 
 
 		 714 aa  87.8  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  37.84 
 
 		 613 aa  87.8  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  39.13 
 
 		 699 aa  87.4  8e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02129  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 667 aa  87  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220582  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  35.76 
 
 		 617 aa  86.7  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  22.32 
 
 		 729 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.26 
 
 		 615 aa  86.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  27.31 
 
 		 614 aa  86.7  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1814  putative putative ferrichrome-iron receptor  22.24 
 
 		 693 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  22.22 
 
 		 704 aa  85.9  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  24.78 
 
 		 615 aa  85.9  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.51 
 
 		 631 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  23.63 
 
 		 729 aa  85.9  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  35.76 
 
 		 649 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  23.17 
 
 		 712 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>