More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5676 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  65.32 
 
 		 656 aa  820    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 662 aa  1331    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  64.8 
 
 		 655 aa  828    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  50.49 
 
 		 690 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  49.84 
 
 		 695 aa  590  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  47.87 
 
 		 692 aa  585  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  46.81 
 
 		 680 aa  552  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  44.93 
 
 		 673 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  44.46 
 
 		 671 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1339  TonB-dependent receptor  35.86 
 
 		 714 aa  356  7.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.368228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  34.81 
 
 		 642 aa  319  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 634 aa  318  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  32.12 
 
 		 646 aa  306  6e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  32.01 
 
 		 638 aa  296  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 670 aa  275  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 659 aa  258  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  33.28 
 
 		 671 aa  253  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 682 aa  241  4e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  28.8 
 
 		 634 aa  236  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 641 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  28.27 
 
 		 613 aa  224  4e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  30.93 
 
 		 623 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 632 aa  218  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2063  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 645 aa  216  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.785465  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  30.02 
 
 		 618 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 625 aa  206  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3696  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 620 aa  199  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.405494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0628  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  26.78 
 
 		 638 aa  189  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288278  normal  0.81106 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 634 aa  177  8e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 614 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  29.03 
 
 		 611 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 611 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 626 aa  172  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.28 
 
 		 631 aa  171  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 626 aa  170  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.03 
 
 		 615 aa  170  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 647 aa  169  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  27.16 
 
 		 617 aa  168  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 627 aa  167  4e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1382  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 655 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00890122  normal  0.0713693 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 698 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.74 
 
 		 623 aa  161  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  27.34 
 
 		 614 aa  161  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 615 aa  157  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 737 aa  157  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.00000231942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 593 aa  156  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.56 
 
 		 615 aa  155  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1684  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 668 aa  154  5e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 638 aa  153  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 624 aa  151  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 627 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 641 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 613 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 602 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 624 aa  148  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.93 
 
 		 631 aa  146  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 628 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 640 aa  145  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  27.69 
 
 		 680 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  27.07 
 
 		 685 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  27.07 
 
 		 685 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  27.07 
 
 		 685 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  27.07 
 
 		 821 aa  144  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.21 
 
 		 613 aa  144  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  27.07 
 
 		 685 aa  144  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 616 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  27.07 
 
 		 685 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  24.96 
 
 		 597 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  27.07 
 
 		 685 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  26.02 
 
 		 661 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 637 aa  139  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  25.65 
 
 		 623 aa  139  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0521  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 617 aa  136  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  25.46 
 
 		 620 aa  136  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.45 
 
 		 616 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  27.69 
 
 		 623 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 642 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.12 
 
 		 1023 aa  131  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 629 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5855  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 642 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.699256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3916  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 642 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4452  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 642 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 735 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3886  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 642 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.322303 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.94 
 
 		 630 aa  128  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2213  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 621 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 619 aa  124  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4173  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 638 aa  123  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.422037  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  26.44 
 
 		 621 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0721  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  23.1 
 
 		 640 aa  123  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  25.27 
 
 		 639 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.61 
 
 		 619 aa  118  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 627 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  37.78 
 
 		 628 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  25.61 
 
 		 704 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  37.43 
 
 		 614 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 		 635 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  25.38 
 
 		 665 aa  111  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 702 aa  112  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  25.38 
 
 		 665 aa  111  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>